24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3252  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lyl163com

金虫 (正式写手)

[求助] 用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何设置为中心原子

用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何简化为中心原子,即怎么选择,怎么简化?先谢过各大侠了!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MOFs相关必读-晶体生长 晶体生长方法 初学晶体 我的
晶体作图方法 淘帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐此不疲

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lyl163com: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
先用shelx软件在配体中间插入原子,与其他原子相连,删除多余原子。保存,做一次XL运算。这个时候的CIF文件就是简化后的配体了,具体看看给你传的这个附件。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : TOPOS4.0检查MOF拓扑简易操作流程.pdf
  • 2012-05-22 23:09:02, 992.98 K
3楼2012-05-22 23:12:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

乐此不疲

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢应助~ 2012-05-23 12:30:51
首先做AutoCN 用算检查你所要的原子的配位数(图1中的 CN )是否是你要的
再双击化合物名字,跳出Crystal data 窗口 选择Adjacency Matrix(如图二)
在这个窗口中点击中心原子前面的的加号,下面显示的就是软件计算的与你原子配位的原子,检查好。如果有原子没与中心原子参与配位,那么把它选中,右击鼠标,在change type里选择No Bond。(建议把氢原子删除)改好之后然后点保存。
这个时候你回去做ADS计算,这个中心原子的简化就是对的。

1



2



3

2楼2012-05-22 23:00:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl163com

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 乐此不疲 at 2012-05-22 23:12:00
先用shelx软件在配体中间插入原子,与其他原子相连,删除多余原子。保存,做一次XL运算。这个时候的CIF文件就是简化后的配体了,具体看看给你传的这个附件。

这样用shelx在配体中间插入原子呢?谢谢
4楼2012-05-28 08:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ys851216

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lyl163com at 2012-05-28 08:15:19
这样用shelx在配体中间插入原子呢?谢谢...

我的经验是使用画图工具(如diamond)在所需位置插入假原子,然后保存为cif格式,这样比在shelx中进行操作要简单很多,不过这样重新生成的cif无法直接打开,不管他,导入topos就可以了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

人生为棋,我愿为卒,虽然移动缓慢,但谁曾见我后退。
5楼2012-05-28 08:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂310 +6 温柔的晚安 2026-03-25 7/350 2026-03-28 16:04 by qq2000
[考研] 0703化学求调剂 +9 奶油草莓. 2026-03-22 10/500 2026-03-28 13:30 by 唐沐儿
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +8 辰沐5211314 2026-03-26 8/400 2026-03-28 11:25 by xuxiang
[考研] 085602 307分 求调剂 +7 不知道叫什么! 2026-03-26 7/350 2026-03-28 09:57 by 神马都不懂
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +8 曼111 2026-03-24 9/450 2026-03-28 07:58 by YYYYX1234
[考研] 085404求调剂,总分309,本科经历较为丰富 +4 来财aa 2026-03-25 4/200 2026-03-28 07:41 by 棒棒球手
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 340求调剂 +3 Amber00 2026-03-26 3/150 2026-03-26 18:57 by 不吃魚的貓
[考研] 271求调剂 +6 生如夏花… 2026-03-22 6/300 2026-03-26 16:48 by 张凯十八号
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 考研一志愿苏州大学初始315(英一)求调剂 +3 sbdksD 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:16 by xcjcqu
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
信息提示
请填处理意见