| 查看: 3039 | 回复: 9 | ||||||||
[求助]
用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何设置为中心原子
|
| 用TOPOS分析拓扑时三连接配体的如何简化为中心原子，即怎么选择，怎么简化？先谢过各大侠了！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 MOFs相关必读-晶体生长 | 晶体生长方法 | 初学晶体 | 我的 |
| 晶体作图方法 | 淘帖 |
» 猜你喜欢
请问各位大佬ACS投稿状态这样是成功了吗？
已经有6人回复
-
中南大学易小艺课题组诚招2026申请-考核制博士生
已经有0人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有165人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
含有三价铁的溶液中如何方便快速的检测是否有二价铁
已经有9人回复- 用castep进行高压下铁的第一性原理计算，设置和结果对比的问题？
已经有12人回复
- 用VASP算理想强度应该如何设置？请说详细点，我算的是FCC结构的。
已经有3人回复
- 关于是否用流动相配样的问题
已经有5人回复
- 岛津LC20液相制备工作站labsolution设置问题
已经有3人回复
- 求查询金属化合物的晶格参数,晶体结构,空间群,以及原子位置相关的网站或者书籍
已经有15人回复
- DNA与一个染料连接后如何鉴定？
已经有9人回复
- 吡啶类的配体加酸后还能配位吗
已经有13人回复
- 求助，原子吸收光谱是不是只能检测较高浓度的重金属，比如说ppm级的？
已经有9人回复
- 有用1,3,5-三苯甲酸离子做配体的没？
已经有17人回复
- 原子核单粒子运动与集体运动
已经有7人回复
- AMBER原子类型怎么修改？
已经有7人回复
- H原子 在Al2O3 晶体中掺杂， Kpoints 设置
已经有6人回复
- 原子荧光无火焰
已经有6人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- 如何判断羧酸配体与中心原子时单齿配位还是螯合作用
已经有29人回复
- 【求助】由topos软件怎么分析具有金属cluster的MOF拓扑结构？
已经有8人回复
乐此不疲
木虫 (正式写手)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 2973.3
- 散金: 1638
- 红花: 17
- 帖子: 858
- 在线: 320.5小时
- 虫号: 1076256
- 注册: 2010-08-17
- 专业: 材料物理化学
【答案】应助回帖
★
感谢参与，应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢应助~ 2012-05-23 12:30:51
感谢参与，应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢应助~ 2012-05-23 12:30:51
|
首先做AutoCN 用算检查你所要的原子的配位数（图1中的 CN ）是否是你要的 再双击化合物名字，跳出Crystal data 窗口 选择Adjacency Matrix(如图二) 在这个窗口中点击中心原子前面的的加号，下面显示的就是软件计算的与你原子配位的原子，检查好。如果有原子没与中心原子参与配位，那么把它选中，右击鼠标，在change type里选择No Bond。（建议把氢原子删除）改好之后然后点保存。 这个时候你回去做ADS计算，这个中心原子的简化就是对的。  1  2  3 |
2楼2012-05-22 23:00:24
乐此不疲
木虫 (正式写手)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 2973.3
- 散金: 1638
- 红花: 17
- 帖子: 858
- 在线: 320.5小时
- 虫号: 1076256
- 注册: 2010-08-17
- 专业: 材料物理化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lyl163com: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
lyl163com: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-05-25 18:33:49
| 先用shelx软件在配体中间插入原子，与其他原子相连，删除多余原子。保存，做一次XL运算。这个时候的CIF文件就是简化后的配体了，具体看看给你传的这个附件。 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : TOPOS4.0检查MOF拓扑简易操作流程.pdf
2012-05-22 23:09:02, 992.98 K
3楼2012-05-22 23:12:00
4楼2012-05-28 08:15:19
ys851216
木虫 (正式写手)
- CMEI: 2
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1934.2
- 帖子: 573
- 在线: 174.9小时
- 虫号: 849448
- 注册: 2009-09-16
- 性别: GG
- 专业: 配位化学
lyl163com
5楼2012-05-28 08:58:50
6楼2012-05-28 17:23:52
7楼2013-03-04 09:53:07
心蕊rxr
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2971.4
- 散金: 16
- 红花: 3
- 帖子: 165
- 在线: 75.8小时
- 虫号: 1563044
- 注册: 2012-01-04
- 性别: MM
- 专业: 配位化学
8楼2013-11-06 18:32:19
Little-优优
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 6357.9
- 散金: 2634
- 红花: 14
- 帖子: 1177
- 在线: 249.1小时
- 虫号: 1655908
- 注册: 2012-03-01
- 专业: 高分子科学
9楼2013-11-13 09:49:23
| 感谢分享 |
10楼2014-01-17 14:42:31