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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质信号肽预测的相关软件已有1人参与

1.麻烦有经验的大虫们推荐给我几个比较可靠的信号肽预测软件最好有使用说明,在论坛里找过几个,但有的进不去,是不是版本更新的问题啊,辛苦各位大虫啦
2.我用了SignalP软件预测,为什么3.0版本与4.0版本预测的结果不一样啊,这个让我很纠结
3.怎么知道一个未知蛋白是不是分泌蛋白,除了通过进行表达之外,预测可以预测出来么?
谢谢啦,辛苦各位大虫,帮帮忙,小虫真的很急
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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-05-05 19:02:26:
以下网站对目的蛋白的信号肽进行分析:
   http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
   http://www.stepc.gr/~synaptic/sigfind.html
   http://bioinformatics.leeds.ac.uk/prot_analysis/Signal.html

我还想请教你一下,D值预测是否是分泌蛋白的标准是什么呢,有一个标准值吧,希望得到你的帮助你有相关的文献,可以传给我一份么,我的宿主是CHO细胞
5楼2012-05-07 08:04:03
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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuluoqiutong at 2012-05-05 17:22:40:
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
这个我用过的,挺好用的

我还想请教你一下,D值预测是否是分泌蛋白的标准是什么呢,有一个标准值吧,希望得到你的帮助你有相关的文献,可以传给我一份么,我的宿主是CHO细胞
6楼2012-05-07 08:22:42
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