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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质信号肽预测的相关软件已有1人参与

1.麻烦有经验的大虫们推荐给我几个比较可靠的信号肽预测软件最好有使用说明,在论坛里找过几个,但有的进不去,是不是版本更新的问题啊,辛苦各位大虫啦
2.我用了SignalP软件预测,为什么3.0版本与4.0版本预测的结果不一样啊,这个让我很纠结
3.怎么知道一个未知蛋白是不是分泌蛋白,除了通过进行表达之外,预测可以预测出来么?
谢谢啦,辛苦各位大虫,帮帮忙,小虫真的很急
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yuluoqiutong

木虫 (正式写手)

初出茅庐

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
若然飞翔: 金币+4, 有帮助, 我也用了这个,想和你就这个软件交流一下 2012-05-07 08:02:01
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-07 13:50:19
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
这个我用过的,挺好用的
2楼2012-05-05 17:22:40
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
若然飞翔: 金币+3, 有帮助, 第二个网页打不开啊,怎么回事呢? 2012-05-07 08:21:28
小丹木木: 金币+2, 专家考核, 专家辛苦了 2012-05-07 13:50:36
3楼2012-05-05 19:02:26
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chaovt714

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
若然飞翔: 金币+3, 有帮助, 谢谢啦 2012-05-07 08:02:20
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-07 13:50:46
4楼2012-05-05 20:40:50
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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-05-05 19:02:26:
以下网站对目的蛋白的信号肽进行分析:
   http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
   http://www.stepc.gr/~synaptic/sigfind.html
   http://bioinformatics.leeds.ac.uk/prot_analysis/Signal.html

我还想请教你一下,D值预测是否是分泌蛋白的标准是什么呢,有一个标准值吧,希望得到你的帮助你有相关的文献,可以传给我一份么,我的宿主是CHO细胞
5楼2012-05-07 08:04:03
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若然飞翔

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuluoqiutong at 2012-05-05 17:22:40:
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
这个我用过的,挺好用的

我还想请教你一下,D值预测是否是分泌蛋白的标准是什么呢,有一个标准值吧,希望得到你的帮助你有相关的文献,可以传给我一份么,我的宿主是CHO细胞
6楼2012-05-07 08:22:42
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yuluoqiutong

木虫 (正式写手)

初出茅庐

【答案】应助回帖

★ ★ ★
若然飞翔: 金币+3, 有帮助 2012-05-08 15:39:08
引用回帖:
6楼: Originally posted by 若然飞翔 at 2012-05-07 08:22:42:
我还想请教你一下,D值预测是否是分泌蛋白的标准是什么呢,有一个标准值吧,希望得到你的帮助你有相关的文献,可以传给我一份么,我的宿主是CHO细胞

具体的标准没注意,不过这个预测玩之后会有一个总结,就是最可能的结果:是不是含有信号肽,具体在哪个位置
7楼2012-05-07 09:41:42
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曼陀罗的祈祷

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuluoqiutong at 2012-05-05 17:22:40
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
这个我用过的,挺好用的

求助signalp4.1分析结果是怎么看的,实验小白跪求大腿
想做个有趣的人,却在逗比的道路上越走越远~
8楼2015-07-27 14:35:04
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萝卜涨价了

铜虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

给楼主一个中文的版本信号肽预测工具,内核和signalp是一样的,中文的使用起来比较方便,而且结果也会直接显示是否含有信号肽,以及相应信号肽的位置:www.detaibio.com/tools/signal-peptide.html
9楼2018-05-09 10:08:05
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