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幸福男人

金虫 (小有名气)

[求助] g09中优化构型的能量如何表示

使用G09程序包,先用小基组b3lyp/6-31g(d,p)对构型进行优化和频率分析,得到的能量如下:
Zero-point vibrational energy     349660.1 (Joules/Mol)
                                   83.57077 (Kcal/Mol)
Zero-point correction=                           0.133179 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy=                    0.147309
Thermal correction to Enthalpy=                  0.148677
Thermal correction to Gibbs Free Energy=         0.081790              (用A表示)

Sum of electronic and zero-point Energies=           -346.650693
Sum of electronic and thermal Energies=              -346.636563
Sum of electronic and thermal Enthalpies=            -346.635194
Sum of electronic and thermal Free Energies=         -346.702081     (用B表示)
再用大基组b3lyp/6-311+g(2df,2p)计算单点能:
SCF Done:  E(RB3LYP) =  -346.895863675                             (用C表示)     
最后考虑到溶剂效应:
SCF Done:  E(RB3LYP) =  -346.904863644   (用D表示)   A.U. after   12 cycles
             Convg  =    0.5522D-08             -V/T =  2.0047
KE= 3.452718482840D+02 PE=-1.488925327817D+03 EE= 4.562252983460D+02
SMD-CDS (non-electrostatic) energy           (kcal/mol) =      -0.66  (用E表示)
(included in total energy above)
那么优化构型的最终能量该如何表示呢?(由于反应温度为135摄氏度,想用自由能表示)我初学高斯,还请各位赐教。
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幸福男人

金虫 (小有名气)

考虑到溶剂效应也用大基组b3lyp/6-311+g(2df,2p)计算的
2楼2012-04-30 22:46:33
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幸福男人

金虫 (小有名气)

我看到有的文献是这样计算的:所有化合物的吉布斯自由能都由化合物的气相全电子能C+气相吉布斯自由能校正项A+溶剂对吉布斯自由能的校正项计算而得

而溶剂对吉布斯自由能的校正项=D-C
这样吉布斯自由能=D+A。计算单点能C岂不是没意义了。困惑
请高手指点迷津,吉布斯自由能该如何表示?
3楼2012-05-01 06:49:06
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幸福男人

金虫 (小有名气)

在小木虫上我看到:溶液下溶质的总自由能= Esoln(溶液下溶质的总能量)+Gnes(溶解增加的自由能)+deltaGcorr_gas(气相下溶质的热自由能校正)。Esoln+Gnes的值在PCM计算后在log文件中作为Total free energy in solution: with all non electrostatic terms 项自动给出,而deltaGcorr_gas是在气相下作freq计算后得到的值。注意,在这里溶液和气相下溶质的结构需要分别在液相和气相重作结构优化,很有可能是不一样的。

这种方法意味着:溶液下溶质的总自由能需要在液相重作结构优化,要用大基组吗?
如果只用气相几何,考虑到溶剂对吉布斯自由能的校正,该如何计算溶液下溶质的总自由能呢?
4楼2012-05-01 08:32:43
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richen0564

金虫 (著名写手)

顶起
等 sobereva大师和小卒等大师过来解答
5楼2012-05-03 12:26:12
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sesy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 幸福男人 at 2012-05-01 06:49:06
我看到有的文献是这样计算的:所有化合物的吉布斯自由能都由化合物的气相全电子能C+气相吉布斯自由能校正项A+溶剂对吉布斯自由能的校正项计算而得

而溶剂对吉布斯自由能的校正项=D-C
这样吉布斯自由能=D+A。计算 ...

楼主现在应该明白了吧、我现在写文章也在这个问题上很困扰、请问最后的吉布斯自由能该如何表示?是不是大基组计算单点能+Thermal correction to Gibbs Free Energy?
Fighting!!!
6楼2012-09-04 09:47:28
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幸福男人

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sesy at 2012-09-04 09:47:28
楼主现在应该明白了吧、我现在写文章也在这个问题上很困扰、请问最后的吉布斯自由能该如何表示?是不是大基组计算单点能+Thermal correction to Gibbs Free Energy?...

如果是气相几何,是大基组计算单点能+Thermal correction to Gibbs Free Energy
7楼2012-09-05 05:40:19
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sesy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 幸福男人 at 2012-09-05 05:40:19
如果是气相几何,是大基组计算单点能+Thermal correction to Gibbs Free Energy...

谢谢哈 现在明白了
Fighting!!!
8楼2012-09-10 08:35:44
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