| 查看: 2206 | 回复: 7 | |||
boylc789木虫 (著名写手)
独孤
|
[交流]
【讨论】结构用opt优化不了，而用opt=z-matrix却能优化 已有3人参与
|
|
结构用opt优化不了，而用opt=z-matrix却能优化 用opt时只优化2步，一会就结束了，报错 而加了opt=z-matrix却能继续优化 坐标用笛卡尔和内坐标都一样 不知道opt和opt=z-matrix有什么区别 我用的内标标#p opt=z-matrix freq uff geom=connectivity zuo biao wei z-matrix 0 1 S-S_R C-C_R 1 1.44658224 C-C_R 2 3.85220366 1 111.31578265 C-C_R 2 1.51864093 1 111.67730330 3 -10.98901335 0 N-N_R 4 1.34789193 2 126.33813523 1 90.00000000 0 C-C_R 5 1.35109775 4 107.42366900 2 0.00000000 0 C-C_R 6 1.35413245 5 113.60018716 4 -108.67531855 0 C-C_R 7 1.38406212 6 119.75985675 5 -139.82692984 0 输出文件有这样一句话 no z-matrix variabless,so optimization will use cartesian coordinates 我在用gv设置时选择了保存成内坐标形式，但是只有上面那样的数字，没有用字母代替的变量，不知道要怎没弄才能自动出来带变量的内坐标~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
瑞典林雪平大学范立洲课题组现招聘博士后、岗位制博士生
已经有0人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有37人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有143人回复
-
中国科大仿生界面材料科学全国重点实验室戴懿涛研究员/江雷院士团队招聘科研助理
已经有0人回复
-
中国科大仿生界面材料科学全国重点实验室戴懿涛研究员/江雷院士团队招聘科研助理
已经有0人回复
-
寻求物理化学学报最新的投稿模板！
已经有4人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
投稿咨询
已经有7人回复
-
自科面上 散金币 祈福
已经有61人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有60人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 运行已经编译好的资源：vasp52opt.rar 出现并行不能用的问题！
已经有3人回复
- 结构优化 a=b ----> a不等于b
已经有3人回复
- 【课件】结构优化设计（崔昌禹，哈尔滨工业大学）
已经有65人回复
- 分享JMC综述：用于太阳能电池的二氧化钛纳米管的结构优化
已经有289人回复
- 基态构型opt优化后的结构并不是势能面上能量的最低点，这是为啥呀？
已经有5人回复
- #p ccsd(t)/cc-pwCVQZ iop(5/13=1) opt freq 提示输入文件有错 用的是GS09
已经有8人回复
- 有关O=S=O的OPT优化
已经有14人回复
- 【求助】同一个结构，G09和G03 opt计算的能量差别大吗？
已经有7人回复
- 【求助】MS4.4 优化失败，但是此结构放在MS2.2却能优化成功
已经有14人回复
- 【求助】关于高斯部分优化
已经有3人回复
- 【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析
已经有56人回复
2楼2010-12-17 12:34:24
boylc789
木虫 (著名写手)
独孤
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3144.7
- 散金: 82
- 红花: 5
- 帖子: 1775
- 在线: 539.1小时
- 虫号: 579648
- 注册: 2008-07-11
- 专业: 理论和计算化学
|
输入#p opt=calcall freq uff geom=connectivity 输出Convergence limit is 0.750E-04 MaxStp= 10000 StMxLn= 1.00D-04 StpMin= 1.00D-06. Convergence criteria 0.00011250 0.00007500 0.00045000 0.00030000 Step NS ND Rises OKQ Scale Max. Force RMS Force Max. Disp. RMS Disp. Energy Flag 1 0 0 F T 1.00D+0021.82694343 1.2433969021.82694343 1.24339690 70.8119302 ---- 2 0 0 T F 2.95D-0121.82694343 1.24339690 6.43474252 0.36656250 512.1562159 ---- 3 0 0 F F -6.49D-0121.82694343 1.24339690 4.17349368 0.23774786 38.4967373 ---- 4 0 0 F F -5.44D-0221.82694343 1.24339690 0.22717131 0.01294107 19.6907402 ---- 5 0 0 F F 8.50D+0021.82694343 1.24339690 1.93198734 0.11005788 19.3688902 ---- 6 0 0 F F 3.19D-0121.82694343 1.24339690 0.61595458 0.03508856 17.2773437 ---- 7 0 0 F F -9.58D-0421.82694343 1.24339690 0.00058983 0.00003360 -5.4813779 ---+ 8 0 0 T T 1.00D+0032.05086287 0.9313414932.08325800 0.93227913 -4.6077310 ---- 9 0 0 T F 1.41D-0232.05086287 0.93134149 0.45250491 0.01314894 394.3940137 ---- 10 0 0 T F 1.14D-0332.05086287 0.93134149 0.00051735 0.00001503 16.9729038 ---+ 11 0 0 T T 1.00D+0032.00000000 0.9319161631.99011971 0.93163126 -5.1749010 ---- 12 0 0 T F 1.57D-0232.00000000 0.93191616 0.50318471 0.01465398 398.4624593 ---- 13 0 0 T F 1.46D-0332.00000000 0.93191616 0.00073582 0.00002143 16.9846570 ---+ 14 0 0 T T 1.00D+00 0.62346650 0.06270841 0.62327458 0.06268846 -5.0629208 ---- 15 0 0 T F 1.43D-01 0.62346650 0.06270841 0.08888005 0.00893948 1.9788188 ---- 16 0 0 F F 1.99D-02 0.62346650 0.06270841 0.00176858 0.00017788 -17.7952662 ---+ 17 0 0 F T 1.00D+00 0.45797486 0.05010664 0.37253161 0.04130206 -18.0630737 ---- 18 0 0 T F 3.23D-02 0.45797486 0.05010664 0.01201647 0.00133225 10.1288533 ---- 19 0 0 T T 1.00D+0064.05326911 1.8593708364.05326911 1.85937083 -8.1303313 ---- 。。。 。。。 6017 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6018 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6019 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6020 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6021 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6022 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6023 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6024 0 0 T F 5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+ 6025 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ---- 6026 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ---- 6027 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ---- 6028 0 0 F T -1.00D+00*********** NaN 0.00000000 0.00000000 NaN -+++ 6029 0 0 F T -1.00D+00*********** NaN 0.00000000 0.00000000 NaN -+++ 6030 0 0 F T -1.00D+00*********** NaN 0.00000000 0.00000000 NaN -+++ MMCGO1: length NaN force NaN so reinitializing CG. 6031 0 0 F T 1.00D+00*********** NaN*********** NaN NaN -+-+ 6032 0 0 F T -1.00D+00 NaN NaN 0.00000000 0.00000000 NaN ==== Energy per function type: UFF 3-term bend 122.335479897 UFF torsion fixed V 0.111556022 UFF torsion w/ sp3 V 0.150780504 Three term Wilson angle 0.041411193 Energy per function class: Coulomb NaN Vanderwaals NaN Out-of-plane 0.041411193 Energy= NaN NIter= 0. 。。。 Cartesian Forces: Max NaN RMS NaN Force constants in internal coordinates: Leave Link 716 at Fri Dec 17 08:50:35 2010, MaxMem= 2147483648 cpu: 6.0 (Enter /home/cliu/bin/g09/l103.exe) GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. Search for a local minimum. Step number 1 out of a maximum of 2 All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians) RMS Force = NaN SwitMx=.10000D-02 MixMth= 2 Mixed Optimization -- En-DIIS/RFO-DIIS Second derivative matrix not updated -- analytic derivatives used. NTrRo=3 is not 5 or 6. Error termination via Lnk1e in /home/cliu/bin/g09/l103.exe at Fri Dec 17 08:50:36 2010. Job cpu time: 0 days 0 hours 12 minutes 3.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 151 Int= 0 D2E= 0 Chk= 146 Scr= 1 |
3楼2010-12-17 12:59:47
4楼2010-12-17 13:14:24
qzhaosdu
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1401.6
- 散金: 2052
- 红花: 7
- 帖子: 1969
- 在线: 263.5小时
- 虫号: 493351
- 注册: 2008-01-10
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
5楼2010-12-17 15:03:14
boylc789
木虫 (著名写手)
独孤
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3144.7
- 散金: 82
- 红花: 5
- 帖子: 1775
- 在线: 539.1小时
- 虫号: 579648
- 注册: 2008-07-11
- 专业: 理论和计算化学
6楼2010-12-17 15:20:35
7楼2010-12-17 15:29:25
boylc789
木虫 (著名写手)
独孤
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3144.7
- 散金: 82
- 红花: 5
- 帖子: 1775
- 在线: 539.1小时
- 虫号: 579648
- 注册: 2008-07-11
- 专业: 理论和计算化学
8楼2010-12-17 18:17:13
20