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boylc789

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[交流] 【讨论】结构用opt优化不了，而用opt=z-matrix却能优化已有3人参与

结构用opt优化不了，而用opt=z-matrix却能优化
用opt时只优化2步，一会就结束了，报错
而加了opt=z-matrix却能继续优化
坐标用笛卡尔和内坐标都一样
不知道opt和opt=z-matrix有什么区别

我用的内标标#p opt=z-matrix freq uff geom=connectivity

zuo biao wei z-matrix

0 1
S-S_R
C-C_R             1 1.44658224
C-C_R             2 3.85220366 1  111.31578265
C-C_R             2 1.51864093 1  111.67730330 3  -10.98901335 0
N-N_R             4 1.34789193 2  126.33813523 1 90.00000000 0
C-C_R             5 1.35109775 4  107.42366900 2 0.00000000 0
C-C_R             6 1.35413245 5  113.60018716 4 -108.67531855 0
C-C_R             7 1.38406212 6  119.75985675 5 -139.82692984 0
输出文件有这样一句话
no z-matrix variabless,so optimization will use cartesian coordinates

我在用gv设置时选择了保存成内坐标形式，但是只有上面那样的数字，没有用字母代替的变量，不知道要怎没弄才能自动出来带变量的内坐标~~

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1楼 2010-12-17 11:27:14

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manson1998

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zhou2009(金币+2): 2010-12-17 14:29:34

opt=calcall和freq重复了。。。

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惺惺相惜情不自禁

4楼2010-12-17 13:14:24

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manson1998

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直接opt出错的信息是什么

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惺惺相惜情不自禁

2楼2010-12-17 12:34:24

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boylc789

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引用回帖:

Originally posted by manson1998 at 2010-12-17 12:34:24:
直接opt出错的信息是什么

输入#p opt=calcall freq uff geom=connectivity
输出Convergence limit is  0.750E-04 MaxStp= 10000 StMxLn= 1.00D-04 StpMin= 1.00D-06.
Convergence criteria          0.00011250 0.00007500 0.00045000 0.00030000
  Step  NS  ND Rises OKQ Scale  Max. Force  RMS Force Max. Disp.  RMS Disp.    Energy Flag
   1 0 0 F T  1.00D+0021.82694343 1.2433969021.82694343 1.24339690 70.8119302 ----
   2 0 0 T F  2.95D-0121.82694343 1.24339690 6.43474252 0.36656250  512.1562159 ----
   3 0 0 F F -6.49D-0121.82694343 1.24339690 4.17349368 0.23774786 38.4967373 ----
   4 0 0 F F -5.44D-0221.82694343 1.24339690 0.22717131 0.01294107 19.6907402 ----
   5 0 0 F F  8.50D+0021.82694343 1.24339690 1.93198734 0.11005788 19.3688902 ----
   6 0 0 F F  3.19D-0121.82694343 1.24339690 0.61595458 0.03508856 17.2773437 ----
   7 0 0 F F -9.58D-0421.82694343 1.24339690 0.00058983 0.00003360 -5.4813779 ---+
   8 0 0 T T  1.00D+0032.05086287 0.9313414932.08325800 0.93227913 -4.6077310 ----
   9 0 0 T F  1.41D-0232.05086287 0.93134149 0.45250491 0.01314894  394.3940137 ----
10 0 0 T F  1.14D-0332.05086287 0.93134149 0.00051735 0.00001503 16.9729038 ---+
11 0 0 T T  1.00D+0032.00000000 0.9319161631.99011971 0.93163126 -5.1749010 ----
12 0 0 T F  1.57D-0232.00000000 0.93191616 0.50318471 0.01465398  398.4624593 ----
13 0 0 T F  1.46D-0332.00000000 0.93191616 0.00073582 0.00002143 16.9846570 ---+
14 0 0 T T  1.00D+00 0.62346650 0.06270841 0.62327458 0.06268846 -5.0629208 ----
15 0 0 T F  1.43D-01 0.62346650 0.06270841 0.08888005 0.00893948 1.9788188 ----
16 0 0 F F  1.99D-02 0.62346650 0.06270841 0.00176858 0.00017788  -17.7952662 ---+
17 0 0 F T  1.00D+00 0.45797486 0.05010664 0.37253161 0.04130206  -18.0630737 ----
18 0 0 T F  3.23D-02 0.45797486 0.05010664 0.01201647 0.00133225 10.1288533 ----
19 0 0 T T  1.00D+0064.05326911 1.8593708364.05326911 1.85937083 -8.1303313 ----
。。。
。。。
6017 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6018 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6019 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6020 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6021 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6022 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6023 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6024 0 0 T F  5.00D-01********************** 0.00195313 0.00009845************* ---+
  6025 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ----
  6026 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ----
  6027 0 0 F T -1.00D+00********************** 0.19522615 0.01825742************* ----
  6028 0 0 F T -1.00D+00***********       NaN 0.00000000 0.00000000       NaN -+++
  6029 0 0 F T -1.00D+00***********       NaN 0.00000000 0.00000000       NaN -+++
  6030 0 0 F T -1.00D+00***********       NaN 0.00000000 0.00000000       NaN -+++
MMCGO1:  length    NaN force    NaN so reinitializing CG.
  6031 0 0 F T  1.00D+00***********       NaN***********       NaN       NaN -+-+
  6032 0 0 F T -1.00D+00       NaN       NaN 0.00000000 0.00000000       NaN ====
Energy per function type:
UFF 3-term bend                                     122.335479897
UFF torsion fixed V                                  0.111556022
UFF torsion w/ sp3 V                                  0.150780504
Three term Wilson angle                               0.041411193
Energy per function class:
      Coulomb                      NaN
Vanderwaals                      NaN
Out-of-plane             0.041411193
Energy=             NaN NIter= 0.
。。。
Cartesian Forces:  Max          NaN RMS          NaN
Force constants in internal coordinates:
Leave Link  716 at Fri Dec 17 08:50:35 2010, MaxMem= 2147483648 cpu:    6.0
(Enter /home/cliu/bin/g09/l103.exe)

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Search for a local minimum.
Step number 1 out of a maximum of 2
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
RMS Force =       NaN SwitMx=.10000D-02 MixMth= 2
Mixed Optimization -- En-DIIS/RFO-DIIS
Second derivative matrix not updated -- analytic derivatives used.
NTrRo=3 is not 5 or 6.
Error termination via Lnk1e in /home/cliu/bin/g09/l103.exe at Fri Dec 17 08:50:36 2010.
Job cpu time:  0 days  0 hours 12 minutes  3.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 151 Int=    0 D2E=    0 Chk= 146 Scr=    1

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3楼2010-12-17 12:59:47

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