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用本地blast得到的同源序列怎样才能下载成FASTA格式?
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专业: 生物大分子结构与功能
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用本地blast得到的同源序列怎样才能下载成FASTA格式?
举例说, 我使用本地BLASTp 找同源序列。得到的是一堆氨基酸序列的编号,如GRMZM2G078508_P01、GRMZM2G064371_P03、GRMZM2G116204_P01 等等。 现在我需要这些氨基酸序列对应的核苷酸序列,并把核苷酸序列下载,并以FASTA格式储存。 请问本地BLAST程序应该有这个功能吧? 相关的DOS命令是什么?
补充说明,这些氨基酸序列编号是玉米B73的, 在NCBI上找不到对应的序列。Maizesequence的我不会用,所以想通过本地BLAST程序找到这些同源序列的核苷酸序列。
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2012-04-24 11:02:23
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