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可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] AutoDock对接结果中具体结合部位相互作用如何分析

请问:
    AutoDock对接结果中具体结合部位相互作用如何分析?就点 Analyze→Dockings→Show interactions,如果选择显示氢键作用,则显示出主客体间的氢键相互作用;若不选择显示氢键作用,则与受体有作用的部分将会显示球形。
    有没有更具体一点的,比如还显示出能量,距离之类的。当然具体是哪种相互作用估计要自己判断了。谢谢。
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

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jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-23 14:46:10
可米kemi: 金币+10, 哦。我一直是用ADT看对接结果的,只能得到主客体相互作用的结合自由能。涉及到具体的,真的是没有办法。 2012-04-23 14:55:50
建议用PYMOL或者ligplot去观察AD的对接结果~哈哈~
2楼2012-04-23 11:38:55
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

内容已删除
3楼2012-04-23 14:58:10
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