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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP寻找过渡态
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liuqun

木虫 (小有名气)

[求助] VASP寻找过渡态

要用VASP寻找过渡态，但苦于不知道怎么做准备工作，是吧每个有00 01......07个POSCAR文件夹，是在每个文件夹里都有INCAR POTCAR KPOINT,还是只要在7个POSCAR文件夹外有就可以了呢？请仔细的教一下我
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1楼 2012-04-21 21:52:56
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liuqun

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gaojunfeng83 at 2012-04-22 17:58:21:
2楼说的很对啊，不能算，检查下你的IMAGE 值是否正确，最好贴下出错信息和INCAR设置

.log文件里是这样写的
running on    6 nodes
each image running on    1 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    1 groups
forrtl: No such file or directory
forrtl: No such file or directory
forrtl: No such file or directory
forrtl: No such file or directory
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
forrtl: No such file or directory
forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 6, file /scratch/lq/h/02/stdout
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000000461673  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BB74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (29): file not found, unit 6, file /scratch/lq/h/04/stdout
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000000461673  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BB74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (29): file not found, unit 6, file /scratch/lq/h/05/stdout
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000000461673  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BB74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (29): file not found, unit 8, file /scratch/lq/h/01/OUTCAR
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BDA7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (29): file not found, unit 6, file /scratch/lq/h/03/stdout
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000000461673  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BB74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (29): file not found, unit 6, file /scratch/lq/h/06/stdout
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp52-ff-im-go-v  000000000121CB5D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000121B665  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  00000000011D46B9  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000118424F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000001183A82  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000119487D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  0000000000461673  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BB74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040BAAC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003619A1D994  Unknown               Unknown  Unknown
vasp52-ff-im-go-v  000000000040B9B9  Unknown               Unknown  Unknown
rank 5 in job 1  c15_58292   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 5: return code 29
rank 4 in job 1  c15_58292   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 4: return code 29
rank 3 in job 1  c15_58292   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 3: return code 29
rank 2 in job 1  c15_58292   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 2: return code 29
rank 1 in job 1  c15_58292   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 1: return code 29
INCAR：
SYSTEM =opt
PREC   =Accurate
GGA = PE
ENCUT  =400
ISTART =0;ICHARG =2
ISPIN =1; ISMEAR = 1
SIGMA = 0.01
NSW    =200
IBRION =3
ISIF = 2
EDIFF = 1.0e-05
EDIFFG = -1
POTIM = 0.0
IOPT = 3
MAXMOVE = 0.2
TIMESTEP = 0.1
ICHGIN = 0
IMAGES = 6
SPING = -5
NPAR   =1
LELF  =.TRUE.
LCLIMB = .TRUE.
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6楼2012-04-22 20:18:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-22 09:11:53
计算的文件夹下包括00 01 .....07 INCAR,POTCAR,KPOINT，00......07文件夹下只有POSCAR就可以。
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liuqun
2楼2012-04-22 08:07:13
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liuqun

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-04-22 08:07:13:
计算的文件夹下包括00 01 .....07 INCAR,POTCAR,KPOINT，00......07文件夹下只有POSCAR就可以。

谢谢
回复此楼
3楼2012-04-22 09:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuqun

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-04-22 08:07:13:
计算的文件夹下包括00 01 .....07 INCAR,POTCAR,KPOINT，00......07文件夹下只有POSCAR就可以。

你好，不行呢，我的作业刚提交上去就掉下来了，根本就不给算啊
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-22 16:18:05
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