应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型
51/1返回列表
查看: 1952  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)

[交流] 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型

哪位大侠指导一下怎么用MS建立表面、蛋白质、水的模型啊？用哪个模块，具体是哪些步骤啊？我这个小菜鸟琢磨好久都没琢磨出来，谢谢啦~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-04-17 09:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2012-05-14 10:36:10:
一般都是晶体建立表面吧，首先建立晶体晶胞，然后切出所要的表面，加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的，要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio ...

恩恩，谢谢了，现在准备用gromacs做~
赞一下 回复此楼
5楼2012-05-14 21:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:33:59
不知你所谓“建立表面”是什么表面？
蛋白质和水的模型不用MS建立吧，
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有，可以直接添加即可
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-14 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaizhm

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 10:42:36
一般都是晶体建立表面吧，首先建立晶体晶胞，然后切出所要的表面，加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的，要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio教程吧 版内搜索 或者google
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-14 10:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:45:43:
不知你所谓“建立表面”是什么表面？
蛋白质和水的模型不用MS建立吧，
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有，可以直接添加即可

恩恩，谢谢了，当初想用MS，后面发现好像不行~~~
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-14 21:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭