24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1779  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


[交流] 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型

哪位大侠指导一下怎么用MS建立表面、蛋白质、水的模型啊?用哪个模块,具体是哪些步骤啊?我这个小菜鸟琢磨好久都没琢磨出来,谢谢啦~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:45:43:
不知你所谓“建立表面”是什么表面?
蛋白质和水的模型不用MS建立吧,
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有,可以直接添加即可

恩恩,谢谢了,当初想用MS,后面发现好像不行~~~
4楼2012-05-14 21:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:33:59
不知你所谓“建立表面”是什么表面?
蛋白质和水的模型不用MS建立吧,
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有,可以直接添加即可
2楼2012-05-14 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 10:42:36
一般都是晶体建立表面吧,首先建立晶体晶胞,然后切出所要的表面,加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的,要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio教程吧 版内搜索 或者google
3楼2012-05-14 10:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2012-05-14 10:36:10:
一般都是晶体建立表面吧,首先建立晶体晶胞,然后切出所要的表面,加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的,要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio ...

恩恩,谢谢了,现在准备用gromacs做~
5楼2012-05-14 21:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿安大生物学07初试322、本科二本、调剂求助 +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +7 升格阿达 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:56 by yuyin1233
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 290求调剂 +14 柯淮然 2026-04-12 16/800 2026-04-12 19:22 by dan_wang
[考研] 计算机22408 281分,求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[教师之家] 请问地理、遥感方面,可以做哪些横向项目啊,纵向完不成考核啊 +3 锦衣卫寒战 2026-04-07 5/250 2026-04-11 20:51 by 豫椒
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 346,工科0854求调剂,专硕 +7 moser233 2026-04-10 8/400 2026-04-11 08:52 by 猪会飞
[考研] 342电子信息专硕求调剂 +9 你让我怎么荔枝 2026-04-10 10/500 2026-04-11 08:33 by zhq0425
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +3 加大号饭盒袋 2026-04-10 3/150 2026-04-10 22:23 by 286640313
[考研] 284求调剂 +19 梵@@ 2026-04-06 21/1050 2026-04-10 21:12 by zhouxiaoyu
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 材料复试求调剂 +20 xhhdjdjsjks 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 10:25 by 孙小小12457
[考研] 347材料专硕求调剂 +19 zj8215216 2026-04-06 19/950 2026-04-10 09:36 by 690616278
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 284求调剂 +7 让我上岸吧阿西 2026-04-09 7/350 2026-04-09 18:59 by haironglove
[考研] 材料专硕初试分332一志愿西北工业大学, +12 故人?? 2026-04-09 12/600 2026-04-09 18:34 by Ccclqqq
[考研] 305求调剂 +4 77Qi 2026-04-06 4/200 2026-04-07 20:06 by shanqishi
信息提示
请填处理意见