应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型
51/1返回列表
查看: 1780  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)

[交流] 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型

哪位大侠指导一下怎么用MS建立表面、蛋白质、水的模型啊？用哪个模块，具体是哪些步骤啊？我这个小菜鸟琢磨好久都没琢磨出来，谢谢啦~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-04-17 09:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:45:43:
不知你所谓“建立表面”是什么表面？
蛋白质和水的模型不用MS建立吧，
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有，可以直接添加即可

恩恩，谢谢了，当初想用MS，后面发现好像不行~~~
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-14 21:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:33:59
不知你所谓“建立表面”是什么表面？
蛋白质和水的模型不用MS建立吧，
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有，可以直接添加即可
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-14 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaizhm

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 10:42:36
一般都是晶体建立表面吧，首先建立晶体晶胞，然后切出所要的表面，加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的，要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio教程吧 版内搜索 或者google
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-14 10:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2012-05-14 10:36:10:
一般都是晶体建立表面吧，首先建立晶体晶胞，然后切出所要的表面，加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的，要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio ...

恩恩，谢谢了，现在准备用gromacs做~
赞一下 回复此楼
5楼2012-05-14 21:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 食品与营养（0955）271求调剂 +7 升格阿达 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:56 by yuyin1233
[考研] 211本科材料化工求调剂 +16 YHLAH 2026-04-11 19/950 2026-04-12 22:43 by kyle12138
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 材料085601调剂 +27 何润采123 2026-04-10 29/1450 2026-04-12 22:31 by fqwang
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 297求调剂 +17 ORCHID1 2026-04-10 18/900 2026-04-12 09:59 by zhouwenxian
[考研] 一志愿西北工业大学289 085602 +33 yang婷 2026-04-10 34/1700 2026-04-12 08:11 by Art1977
[考研] 347求调剂 +4 mhyqyy 2026-04-06 4/200 2026-04-12 02:27 by 秋豆菜芽
[考研] 计算机22408 281分，求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[考研] 280求调剂 +13 wzzz王 2026-04-09 13/650 2026-04-12 00:31 by 勇攀高峰0126
[考研] 0854调剂 +8 长弓傲 2026-04-11 9/450 2026-04-11 21:44 by 蓝云思雨
[考研] 269求调剂 +11 啊啊我我 2026-04-07 11/550 2026-04-11 16:45 by vgtyfty
[考研] 吉大计算机技术331分，英语六级，求调剂 +3 峰峰021116 2026-04-09 3/150 2026-04-10 20:01 by chemisry
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-08 6/300 2026-04-10 11:02 by mattzhming
[考研] 已调剂 +18 柴郡猫_ 2026-04-09 19/950 2026-04-09 22:10 by 柴郡猫_
[考研] 材料307分求大佬组收留 +17 Hll胡 2026-04-07 17/850 2026-04-09 10:53 by liuhuiying09
[考研] 277求调剂 +4 考研调剂lxh 2026-04-06 6/300 2026-04-08 10:40 by 逆水乘风
[考研] 22408 调剂材料 +7 我叫ez 2026-04-06 8/400 2026-04-07 17:12 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿西电085401求调剂 +4 sunw1306 2026-04-07 4/200 2026-04-07 16:40 by 啵啵啵0119
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭