24小时热门版块排行榜    

查看: 1749  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


[交流] 如何用MS建立表面、水、蛋白的模型

哪位大侠指导一下怎么用MS建立表面、蛋白质、水的模型啊?用哪个模块,具体是哪些步骤啊?我这个小菜鸟琢磨好久都没琢磨出来,谢谢啦~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:45:43:
不知你所谓“建立表面”是什么表面?
蛋白质和水的模型不用MS建立吧,
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有,可以直接添加即可

恩恩,谢谢了,当初想用MS,后面发现好像不行~~~
4楼2012-05-14 21:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:33:59
不知你所谓“建立表面”是什么表面?
蛋白质和水的模型不用MS建立吧,
蛋白质的模型一般都是在PDB库里下载http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

水分子一般软件里都有,可以直接添加即可
2楼2012-05-14 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★
上善若水-川(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-14 10:42:36
一般都是晶体建立表面吧,首先建立晶体晶胞,然后切出所要的表面,加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的,要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio教程吧 版内搜索 或者google
3楼2012-05-14 10:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2012-05-14 10:36:10:
一般都是晶体建立表面吧,首先建立晶体晶胞,然后切出所要的表面,加真空层就完成了表面建立。

蛋白质多种多样的,要根据你模拟的体系建立模型。

水的模型也可以在ms里面画

你看看创腾的material studio ...

恩恩,谢谢了,现在准备用gromacs做~
5楼2012-05-14 21:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂(有工作经验) +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 6/300 2026-03-18 22:55 by 204818@lcx
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
信息提示
请填处理意见