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astringent

铜虫 (著名写手)

[求助] gmx中可以同时使用显性和隐性溶剂吗 已有1人参与

最近做溶剂化效应的模拟,对反应中心和少量水分子(10个)我采用了QMMM计算,接下来我想在反应中心和这10个水分子周围加隐性溶剂,但是gromacs的manual里好像没有相关极少啊?
我用的是opls力场。请问gromacs中可以同时使用显性溶剂和隐性溶剂吗?如果能,应该怎么设置?能给出例子或这相关资料就最好了。请大家指点,不甚感激。先谢了
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xxj9618

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以设置的,显性溶剂你直接加水就好了,隐形溶剂你在mdp里设置Implicit solvent的参数就可以了
我有我世界。。。
2楼2014-10-24 11:31:02
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