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astringent

铜虫 (著名写手)

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[求助] gmx中可以同时使用显性和隐性溶剂吗已有1人参与

最近做溶剂化效应的模拟，对反应中心和少量水分子（10个）我采用了QMMM计算，接下来我想在反应中心和这10个水分子周围加隐性溶剂，但是gromacs的manual里好像没有相关极少啊？
我用的是opls力场。请问gromacs中可以同时使用显性溶剂和隐性溶剂吗？如果能，应该怎么设置？能给出例子或这相关资料就最好了。请大家指点，不甚感激。先谢了

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1楼 2012-04-13 04:05:10

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xxj9618

银虫 (初入文坛)

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专业: 生物医用高分子材料

【答案】应助回帖

可以设置的，显性溶剂你直接加水就好了，隐形溶剂你在mdp里设置Implicit solvent的参数就可以了

我有我世界。。。

2楼2014-10-24 11:31:02

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