24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2505  |  回复: 8
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看

laverne

铜虫 (小有名气)

[交流] 蛋白突变后不表达了 已有4人参与

大家好,我现在实验遇到个现象,苦恼ing,烦请大家给予指点
定点突变蛋白之后,在bl21中不表达了,尝试各种优化,没有效果,有人能解释这是什么原因吗?
回复此楼
为了更好的生活……
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

laverne

铜虫 (小有名气)

谢谢楼上!
为了更好的生活……
2楼2012-04-10 16:44:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamofyou

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个很正常吧,有的本来表达很好,突变了一个氨基酸表达差很多。
3楼2012-04-20 16:38:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 应助指数+1, 果然专业! 2012-04-23 18:50:33
一般来讲,先确定新的启动子存在且有效,其次确定起始转录位点存在且有效,然后有软件模拟一下mRNA突变后是否构成了二级结构,是否有移码突变,是否构成了稀有密码子,是否提前中断翻译,再有考虑突变产物蛋白质是否构成新的酶切位点和是否在三维结构上发生了折叠异常(引入突变位点也是研究蛋白质折叠的一种常规实验技术)。

还要考虑突变产物蛋白质是不是参与形成了原来没有的超分子结构(聚合体)或者影响了原有的四级结构的形成。
4楼2012-04-20 17:13:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

laverne

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 凌波丽 at 2012-04-20 17:13:50:
一般来讲,先确定新的启动子存在且有效,其次确定起始转录位点存在且有效,然后有软件模拟一下mRNA突变后是否构成了二级结构,是否有移码突变,是否构成了稀有密码子,是否提前中断翻译,再有考虑突变产物蛋白质是 ...

谢谢您的意见!
首先,蛋白突变只发生在c端(原始的蛋白表达量还可以),不涉及启动子以及转录起始位点的变化。
其次,测序结果认真查看了没有发生移码,也没有终止密码子提前形成。
另外,想要跟您请教的是:
我用软件模拟了mRNA突变后的二级结构,看上去是发生了挺大的改变。但是我不知道这个模拟结果该如何分析?您是否可以给些意见?
从自由能来看,原始的是-229kkal/mol, 突变后是-200kkal/mol
ps:由于目标蛋白带有his标签,纯化后完全木有东西,所以没法考虑聚合体形成的问题。
为了更好的生活……
5楼2012-04-23 18:48:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by laverne at 2012-04-23 18:48:37:
谢谢您的意见!
首先,蛋白突变只发生在c端(原始的蛋白表达量还可以),不涉及启动子以及转录起始位点的变化。
其次,测序结果认真查看了没有发生移码,也没有终止密码子提前形成。
另外,想要跟您请教的是: ...

一般来说,由于真核生物细胞中的由于存在翻译起始因子eIF4A,eIF4B在核糖体翻译时去除mRNA的二级结构,所以只要不是很大的二级结构改变一般不至于影响翻译过程。你可以检测一下工程细胞中翻译起始因子eIF4A,eIF4B是否都正常表达,若没有足量的eIF4A,那么mRNA的二级结构二级结构改变可能足以引起表达障碍,若没有足量的eIF4B,那么eIF4A足量表达eIF4A的效率也会很低。
另外,我觉得你该查一下工程细胞的目的蛋白质突变后是不是影响了它与别的蛋白质或DNA特异性片段之间的专一性结合,比如说它原本与某种转录因子又结合,但是突变后使该结合失效。
6楼2012-04-23 22:10:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
还有是考虑可能你的突变蛋白质是表达了,但是因为突变位点引起蛋白质异常折叠或引入了新的酶切位点,使其在工程细胞中没有稳定存在。
7楼2012-04-23 22:17:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

theobromine

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ajdsfhkjadfhksdajfhksajhfkasdjfh
8楼2012-09-20 20:26:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

高亚楠六

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-27 20:24:37
请问楼主找到原因了吗,怎么解决的,我也遇到了同样的问题,突变后不表达了
9楼2016-09-27 16:51:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 laverne 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 327求调剂 +4 Xxjc1107. 2026-04-06 5/250 2026-04-07 18:11 by 蓝云思雨
[考研] 298求调剂 +5 钉叮咚冬瓜 2026-04-07 5/250 2026-04-07 18:04 by jp9609
[考研] 085600材料与化工,求调剂 +5 won_qii 2026-04-07 5/250 2026-04-07 17:10 by 啵啵啵0119
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +3 祁柒连 2026-04-06 3/150 2026-04-07 12:48 by 小木虫gyh
[考研] 求调剂 一志愿西南交通大学085701环境工程 282分 +13 多多爱吃汉堡 2026-04-04 14/700 2026-04-07 11:22 by 诗与自由
[考研] 295求调剂 +18 xndjjj 2026-04-04 19/950 2026-04-07 11:02 by wangjy2002
[考研] 一志愿武理车辆专硕总分 281 求调剂 +4 上岸研究生. 2026-04-02 4/200 2026-04-07 09:52 by 加油向未来啊
[考研] 297分083200求助 +9 aekx 2026-04-05 9/450 2026-04-06 20:57 by flysky1234
[考研] 085405软件工程301分求调剂,专硕可跨专业,四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 324求调剂 +3 k可乐 2026-04-05 4/200 2026-04-06 09:54 by 蓝云思雨
[考研] 272求调剂 +4 松柏常青5 2026-04-03 4/200 2026-04-04 17:03 by babysonlkd
[考研] 一志愿北京科技大学材料工程085601,求调剂 +17 cdyw 2026-04-02 18/900 2026-04-04 11:14 by w_xuqing
[考研] 调剂0855-288 +5 x熊二a 2026-04-03 5/250 2026-04-04 00:19 by 猪会飞
[考研] 350一志愿北京航空航天大学08500材料科学与工程求调剂 +5 kjnasfss 2026-04-03 5/250 2026-04-03 22:29 by 无际的草原
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 11408,284分,二战真诚求调剂 +4 12.27 2026-04-02 4/200 2026-04-03 14:14 by dxiaoxin
[考研] 26考研调剂 +4 Wnz.20030617 2026-04-01 5/250 2026-04-02 16:11 by 1939136013狗壮
[考研] 一志愿北京科技,085601总分305求调剂 +9 半生瓜! 2026-04-01 11/550 2026-04-02 08:28 by Wang200018
[考研] 求调剂,一志愿南京师范大学计算机专硕,初试373,六级通过, +3 计算机追梦人 2026-04-01 3/150 2026-04-02 07:57 by fxue1114
[考研] 379求调剂 +3 ?苦瓜不苦 2026-04-01 3/150 2026-04-01 20:09 by 暮云清寒
信息提示
请填处理意见