| 查看: 1681 | 回复: 3 | ||
[求助]
[讨论交流] 分子动力学+分子对接=什么配置?
|
|
我想请教点事情，请大虾帮忙看看，本人所在课题组最近想预测一个短肽的结构，大概30aa，然后做个peptides-protein对接，正在准备攒个机，价格在两万左右，主要跑GROMACS之类动力学软件，将来还要跑SYBYL DOCK之类对接设计新药,请高手指点，目前看中的： 两颗INTEL 5645 （6核12线程*2=12核24线程）； 或者两颗AMD 6272 （16核*2=32核） 问题：高手看看应该要哪个性价比高一点，这两个品牌cpu效率的差距大么，这些软件对两家CPU的兼容性没问题吧，软件对多核和整体性能哪个要求高点？还有内存、硬盘配置推荐下，高手帮忙啊！！！！！！  |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Sybyl 3D-QSAR Q^2为负
已经有16人回复
- 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
已经有7人回复
- 【求助】关于分子动力学模拟疑惑
已经有6人回复
- 【求助】同源建模、分子动力学模拟和分子对接的关系是怎样的
已经有9人回复
- 【原创】分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖
已经有35人回复
- 【讨论】分子对接的基本问题
已经有8人回复
- 【求助】discovery stdudio 分子对接问题
已经有3人回复
fmtzhangli
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1311.3
- 红花: 1
- 帖子: 73
- 在线: 132.5小时
- 虫号: 908286
- 注册: 2009-11-20
- 专业: 生物信息学
2楼2012-04-10 13:26:10
3楼2012-04-10 13:54:35
leo1252
金虫 (正式写手)
- 应助: 20 (小学生)
- 金币: 1291.7
- 散金: 628
- 红花: 1
- 帖子: 390
- 在线: 170.5小时
- 虫号: 778141
- 注册: 2009-05-23
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-10 23:55:40
小李飞到: 金币+1, ★★★很有帮助, 谢谢，很好的提醒，不过我们在做这个的同时是个学习的过程，所以可能必要的时候会跑超算，但是还是不太方便，熟悉软件还是整一台快点，呵呵~ 2012-04-11 11:08:31
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-10 23:55:40
小李飞到: 金币+1, ★★★很有帮助, 谢谢，很好的提醒，不过我们在做这个的同时是个学习的过程，所以可能必要的时候会跑超算，但是还是不太方便，熟悉软件还是整一台快点，呵呵~ 2012-04-11 11:08:31
| 感觉后面一个性价比高，但是稳定性和兼容性方面可能有待考究了，我只是瞎说，你可以做个参考，不过如果你跑gromacs的话，还是建议你去超算上面去跑，超算上面软件都装好了，上海超算，深圳超算，天津超算，都可以的，如果经费有限，你可以先申请试用超算啊。做对接的话，还是要自己的cluster了。 |
4楼2012-04-10 23:18:57
10