24小时热门版块排行榜    

查看: 1725  |  回复: 6

iloveblowgod

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请问16S rDNA能定量吗?

本科不是学微生物的,现在被老板要求做肠道菌群的课题,好陌生……T^T

提完DNA之后是送到外面去测,请问16S rDNA能定出微生物的量吗?谢谢大家。
回复此楼
未来是属于勇敢的人~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mizhoulong

木虫 (著名写手)

环境卫生、微生物学

纯顶贴,希望引起大牛的注意,同问。
环境卫生、微生物学、卫生应急
2楼2012-04-11 17:09:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小嫩瓜

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
实时定量PCR能定量 看资料上是这么做的。我也想了解这块
活的艰辛是因为执着和不放弃
3楼2012-04-11 18:43:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tdong06

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-11 23:46:52
不行的,定量的话需要用QRT-PCR。
再说了,我就不知道你考虑用16s-rDNA定量什么?
做菌群的话,有DGGE,454-sequencing等等方法
4楼2012-04-11 20:14:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
rainwander: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-12 08:20:15
看你要定啥量, 定DNA浓度,用nanodrop足矣

定细菌的量,有qPCR使用细菌通用引物,

定某种细菌的量,用specific的引物qpcr.
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2012-04-11 23:49:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by tdong06 at 2012-04-11 20:14:10:
不行的,定量的话需要用QRT-PCR。
再说了,我就不知道你考虑用16s-rDNA定量什么?
做菌群的话,有DGGE,454-sequencing等等方法

DGGE我不建议使用,resolution太低了,我做TRFLP感觉效果会好太多了.
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
6楼2012-04-11 23:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by tdong06 at 2012-04-11 20:14:10:
不行的,定量的话需要用QRT-PCR。
再说了,我就不知道你考虑用16s-rDNA定量什么?
做菌群的话,有DGGE,454-sequencing等等方法

我绝对不建议新手做454, 一pyrosequencing太贵,二新手没法分析海量数据.
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
7楼2012-04-12 00:01:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 iloveblowgod 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂(0805) +7 烟汐忆海 2026-03-16 17/850 2026-03-19 09:55 by 30660438
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 271材料工程求调剂 +5 .6lL 2026-03-18 5/250 2026-03-19 03:07 by 无懈可击111
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 311求调剂 +4 冬十三 2026-03-18 4/200 2026-03-18 21:47 by 尽舜尧1
[考研] 085600材料与化工 +5 安全上岸! 2026-03-16 5/250 2026-03-18 15:33 by cmz0325
[考研] 0703化学调剂 +4 pupcoco 2026-03-17 7/350 2026-03-18 12:14 by djl2006
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 329求调剂 +3 miaodesi 2026-03-12 4/200 2026-03-13 20:53 by 18595523086
信息提示
请填处理意见