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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 请问，两条不同来源的DNA序列，相似度达到多少时，才可以判定为同源？
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寇相宇

金虫 (小有名气)

[交流] 请问，两条不同来源的DNA序列，相似度达到多少时，才可以判定为同源？ 已有6人参与

如题～

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成年人的第一口诀：丢开所有借口
1楼 2012-04-09 19:40:28
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)
★
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序列的相似性可以是定量的数值，也可以是定性的描述。相似度是一个数值，反映两条序列的相似程度。关于两条序列之间的关系，有许多名词，如相同、相似、同源、同功、直向同源、共生同源等。 在进行序列比较时经常使用“同源”（homology）和“相似”（similarity）这两个概念，这是两个经常容易被混淆的不同概念。两条序列同源是指它们具有共同的祖先。在这个意义上，无所谓同源的程度，两条序列要么同源，要么不同源。而相似则是有程度的差别，如两条序列的相似程度达到30%或60%。一般来说，相似性很高的两条序列往往具有同源关系。但也有例外，即两条序列的相似性很高，但它们可能并不是同源序列，这两条序列的相似性可能是由随机因素所产生的，这在进化上称为“趋同”（convergence），这样一对序列可称为同功序列。
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帮助虫友，提升自己
2楼2012-04-10 09:04:11
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zjutboss

银虫 (小有名气)
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我也有疑惑，请问楼上，怎么同源序列怎么判断？
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3楼2012-04-10 09:51:48
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寇相宇

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by charon1982 at 2012-04-10 09:04:11:
序列的相似性可以是定量的数值，也可以是定性的描述。相似度是一个数值，反映两条序列的相似程度。关于两条序列之间的关系，有许多名词，如相同、相似、同源、同功、直向同源、共生同源等。 在进行序列比较时经常 ...

那么两条序列如何确定是否同源呢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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成年人的第一口诀：丢开所有借口
4楼2012-04-10 10:00:45
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)
建树
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帮助虫友，提升自己
5楼2012-04-10 12:59:39
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dappxiaomm

金虫 (小有名气)
这个。。。我也很想知道
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6楼2012-04-11 11:01:04
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dongrongshu

木虫 (小有名气)
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在NCBI上可以对两个系列进行比对，但是所谓同源 一般至少要求在99.8%以上，但是也跟运用的软件和计算的方法有关。
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加油！
7楼2012-04-11 18:21:10
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dawnshao

新虫 (小有名气)
是98%吧？
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8楼2012-04-23 14:25:43
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5009918144

新虫 (小有名气)
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引用回帖:
7楼: Originally posted by dongrongshu at 2012-04-11 18:21:10
在NCBI上可以对两个系列进行比对，但是所谓同源 一般至少要求在99.8%以上，但是也跟运用的软件和计算的方法有关。

我想请问下怎么计算得出这个比例的呀？
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9楼2019-07-09 19:27:46
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