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shizishanshang

至尊木虫 (职业作家)


[资源] 利用CODEHOP和iCODEHOP 设计简 并引物

前面给人设计了几对简并引物,说以后给大家上传一个方法的文章。但是原帖子不能上传附件,所以就重新开一贴,放到这里来算了。
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skjtg

金虫 (初入文坛)


请高手帮看看这条蛋白序列的简并引物。
>gi|376316684|emb|CCG00069.1| Cysteine sulfinic acid decarboxylase [uncultured Flavobacteriia bacterium]
MSYALKHTKQRKHTNREAHMILNDLNQPIIESTELDEFFEALCAANYENYEGLIKAHNINFETLLPFASW
SSKSYQRICLASNEECELILLCWDKGQKTPIHSHDGQKCWVYFAKGEFEEFLYAKGEKNNLLQKNSVAEG
QVTFLTDEIGFHSLENKSSGLGMTLHLYANPITKCQVYSESKKEFENKELQYDIDLSDSNRDTEMSADLL
TFIQLSQELLKDENDNPVSQRIPSSELKKVLNIGLEENGINEDQFVETLKKIVLATPKTSSSLFFNQLFG
GRESKAVLGDLLAVMLNNSMYTYKVGGVQVGIEKEIINQVIDRLDYGPHAGGTFPSGGSMSNFMAILMAR
DKVNEVSRQTGLKINMIAYTSAESHYSIEKNAAFIGIGRENVRKIPVNEVGEMRVDSLKAAIDKDLEAGN
TPFFVNATAGTTVLGAFDPIKELGEVCRAYNIWMHVDGAYKGSVLLSEKYKHLLEGSNQADSFSFNPHKM
LGAPLTCSVIVVKDKKHLHDSFSNNAEYLYQTDEDDFNLGKTSFQCGRRNDALKLWTLWKSKGRKGLERI
VDKQFELADYAREYVRNHPDYELYSFDDSIAICFNYKNISADQLCTDLYEHDELMVGYGKFRENEFVRMV
TINHANTKEDIEHFFKVIEAFYTR
下面是我自己用PRIMER5.0做的引物,感觉简并度很高
上游引物:TYAAYCARYTNTTYGGNGG  
下游引物::RTCRTTNCKNCKNCCRCA
18楼2012-06-10 00:02:21
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jinhx872楼
2012-04-06 13:56   回复  
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sjshvdc4楼
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angel19128楼
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sherrysure14楼
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