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小鸟剑客

金虫 (小有名气)

[求助] PCR扩启动子序列的问题

我要扩3200bp的启动子片段,结果用了TAKARA公司的rtaq和PrimeSTARMax聚合酶和TRANSGENE的HiFi酶都跑出来整片的弥散带且没有主带(从100-15000都是弥散的)用TAKARA的LA taq则跑出来另外的片段,求高手相助。
经历:这个片段的引物我去年跑了半年了没问题,以前都可以跑出来回收的,今年来的时候第一次做也没问题,到第二次做的时候就跑出弥散带了,以后1个半月都跑不出主带来。1.我以为是引物的问题,用了新引物,跟以前的一对引物一起跑,结果还是没主带。2.可能是水的问题,换水也没结果。3.重提了3次DNA,前两次用TRANSGENE的DNA提取试剂盒,如图1中所示。后一次是用CTAB法提的。结果两次的提的DNA只有LA taq酶跑出那个奇怪的带4.DNTP和buffer都是配套使用的,也没有什么问题5.给引物和模板给4个人,分别作都是弥散带。6.反应体系15ul.25ul.20ul.50ul都跑过,结果都不好。PCR程序以rTaq为例:
1.94℃  5m
2.94℃  50s
3.60℃  50s(华大建议的正反引物温度为64℃和66.7℃)
4.72℃  3m30s  2   35
5.72℃  10m
6.4℃     1h
LA taq酶跑出的怪带的程序是
1.94℃      5m
2.94℃      1m
3.72℃      2m    (温度是每个循环降0.5℃)  
4.72℃      4m    2      15   
5.94℃      1m
6.65℃      2m
7.72 ℃     3m30s      5       25   
8.72 ℃     10m
9.4 ℃        1h
求高手帮忙解决下啊,快疯了
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