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hlq3175

木虫 (正式写手)

[求助] 【求助】溶剂化效应自由能的输出问题

各位高手帮帮忙呀,我需要用g03算一下我的体系的溶剂化自由能 DeltaG (solv),可是我按照常规的输入#p ccsd(t)/6-311++g(d,p) geom=modredundant scf=tight,它并没有那一项结果输出。根据小木虫里面找的的帖子,我的输入文件改成这样的#p ccsd(t)/6-311++g(d,p) scrf=(pcm,dovacuum,externaliteration) geom=modredundant scf=tight,可是总是出错类似QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
t)/6-311++g(d,p) scrf=(pcm,dovacuum,exte
                            '
Last state="SCR2"
TCursr=38161 LCursr=   35
Error termination via Lnk1e in /home/apps/g03/l1.exe at Mon Mar 12 15:39:46 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      8 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
这些输入文件里面的字母都是我一个一个敲进去的,没有任何空格,可是一提交就出现莫名其妙的空格,不知道是什么情况?另外能不能解释一下这两个dovacuum,externaliteration的意思,尤其是第一个,我在03说明书里没找到他们的解释呀,请各位高手给我指点指点。感激不尽呀!
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hlq3175

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 雨晨田木 at 2012-03-15 09:29:41:
你看看这个吧Comment on the Correct Use of Continuum Solvent Models
dx.doi.org/10.1021/jp107136j

我要的自由能应该是Cavitation energy                        (kcal/mol) =      18.95
Dispersion energy                        (kcal/mol) =     -12.91
Repulsion energy                         (kcal/mol) =       1.17
Total non electrostatic                  (kcal/mol) =       7.22这几项的和,不过我好像应该尝试一下在优化阶段就加上溶剂去试试,谢谢您了。
7楼2012-03-16 10:49:08
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查看全部 11 个回答

雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-03-14 11:04:18
hlq3175(金币+1): 有帮助, 谢谢您,不过我要的是溶剂化自由能,这样子算出来还是没有我要的自由能那一项。 2012-03-14 14:43:25
溶剂效应这样写就行了
%chk=H2O-S.chk
# opt rb3lyp/6-31+g(d,p) SCRF(CPCM,Read,Solvent=Acetonitrile)

H2O Structure in Solution-Phase

0 1
H                  0.00000000    0.77125000   -0.46932000
H                  0.00000000   -0.77125000   -0.46932000
O                  0.00000000    0.00000000    0.11733000

RADII=UAKS
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=雨晨田木&say=不要太辛苦哦。[/img][/url]
2楼2012-03-14 10:33:58
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雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

对于???一个分??结构,分别计算有无溶剂效应时的???布斯自由能,其差值自然??就是溶剂化自由能????
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=雨晨田木&say=不要太辛苦哦。[/img][/url]
3楼2012-03-14 16:44:41
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雨晨田木

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-17 18:58:41
溶剂化自由能不就是溶解后的自由能减去溶解前的吗
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=雨晨田木&say=不要太辛苦哦。[/img][/url]
4楼2012-03-14 16:47:01
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