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lizhijiang

木虫 (著名写手)


[交流] N-末端 氨基酸测序——转膜问题

各位虫友:
    小虫用SDS-PAGE识别到一个分子量110kDa左右(0.75mm)胶,只是想知道N-末端20个氨基酸顺序,不需要保持其活性,之后送到测序公司进行氨基酸识别。已经在网上和自己实践后进行了转膜实验,效果不是很理想。想和虫友共同探讨和完善转膜方案,以便后续试验顺利进行:
    我用PVDF膜进行转膜,然后准备进行N-端氨基酸测序.
1. SDS-PAGE是还原电泳,用考马斯蓝染色条带清晰。
1. PVDF膜放在甲醇里漂洗,去除膜中气泡,便于蛋白转移。
3. 转膜缓冲液用CAPS pH11。
2. 制作三明治。用60V或100v电压转了一个小时,染色用立春红S几分钟。
  可能细节还有问题,期望虫友和有经验的老师提供建议,提供详细方案和建议。之后再进行整理,以便实验顺利进行!
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以寄出去让公司转膜测序吗?卡在一步上很浪费时间的。
7楼2012-07-22 14:38:21
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lizhijiang

木虫 (著名写手)


等待建议,十分感谢!
2楼2012-03-12 20:10:03
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QIN0718

至尊木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包,谢谢回帖
lizhijiang(金币+10): 很全面,十分感谢! 2012-03-13 08:25:47
wizardfan: 金币+10, 谢谢分享经验 2012-08-31 04:55:06
(1)配制CAPS[3-(环己氨基)-1-丙磺酸,3-(cyclohexylamino)-1-propanesulfonic acid]电印迹缓冲液:10×CAPS(100mmol/L):取 CAPS 22.13g,加去离子水至900mL,用2mol/L NaOH (约20mL)将pH值调至11.0,然后定容至1L,贮存于4oC。
(2)CAPS电印迹缓冲液(含10%甲醇的1×CAPS):取10×CAPS 200 mL,加甲醇200 mL,去离子水1600 mL。
(3)取出PVDF膜(Positively charged nylon,Polyvinylidene fluoride,聚偏二氟乙烯膜),用甲醇浸泡数秒钟,然后放入CAPS电印迹缓冲液中。(注:以后的操作须防止PVDF膜干涸。如果膜变干,须重复本步骤的操作;CAPS电印迹缓冲液中的甲醇浓度范围是0-20%,一般甲醇浓度高的缓冲液对低分子量蛋白的转移效果好,而甲醇浓度低甚至不含甲醇的缓冲液则有利于高分子量蛋白的转移。)
(4)取出电泳凝胶,在CAPS缓冲液中浸泡5-10分钟。
(5)将用于电印迹实验的滤纸和海绵放入电印迹缓冲液中浸泡一下,然后按海绵、滤纸、PVDF膜、凝胶、滤纸、海绵的次序将电印迹夹层装好,并放入小型电转槽中,用50V恒压条件下跑空胶2-2.5小时预电泳后再上蛋白样品进行电泳分离。在50V恒压条件下(100-170mA)于室温下进行电印迹转移,转移时间为0.5-2小时。(注:务必小心排尽凝胶和PVDF膜之间的气泡。上述转移条件适用于Bio-Rad小型电转槽和分子量不太大的蛋白。在不同的实验中,应根据具体的电转移装置和具体蛋白适当调整电转移条件。例如对70kD以上的蛋白质须延长转移时间。)
(6) 取出PVDF膜并用去离子水略为漂洗,用甲醇浸泡数秒钟,然后进行染色。
(7) 考马斯亮蓝染色,可将0.1%考马斯亮蓝R-250溶于40%甲醇/1%乙酸,染色30-50秒(切勿超过1分钟),用50%甲醇脱色(注意勤换脱色液),并用去离子水充分洗涤,然后即可剪下待测序的条带,送上海基康生物技术公司进行蛋白质端测序(蛋白质序列测序系统:ABI PROCISETM492cLC)。
3楼2012-03-12 21:25:23
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QIN0718

至尊木虫 (职业作家)


这是我转膜的方案,做了很多次,没有问题的。
5楼2012-03-12 21:26:53
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