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Koddisy

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助2个关于组蛋白的问题,与检测乙酰化和泛素化有关

没有做过组蛋白这方面,实验室其他师兄们也较少涉及,查文献上面基本都是略过...

然后我现在涉及的一个实验中要检测H3的乙酰化,和H2B的泛素化水平。有几个问题不解。

求检测这两者的protocol呀!!
koddisy@gmail.com 跪谢

然后我的问题如下:

1.第一个是组蛋白抽提的问题,用组蛋白试剂盒抽的组蛋白一般是抽得所有组蛋白,还是有不同的试剂盒,可以直接抽到H3?
还是在设计的时候就已经加入纯化标签,比如H2B-FLAG,然后纯化H2B。。。我真不清楚~~

2.乙酰化怎么检测,比如我要检测H3的global的乙酰化水平。又如果我要检测的只是H3K18的乙酰化可以实现吗?乙酰化也是买抗体检测吗?

3.H2B的泛素化怎么检测?我看文献上是直接用泛素化抗体来检测的,是的嘛?

实在是不清楚,请不要笑话我呢,我也是为了能顺利做实验~~~

跪求protocol~~~不甚感激。现在满脑子的疑惑啊!!!
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抗体磷酸化

银虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
大量样品测试,用快速检测组蛋白乙酰化的ELISA方法比较简单,这是南宁蓝光生物技术公司采用的方法:

1) 将处理的细胞(潜在HDAC inhibitor处理?)悬浮液在1.5mL离心管于3000转离心1分钟, 去调上清。 细胞pelet留下萃取组蛋白

2)用50 uL的0.1 N的HCL萃取5uL左右的离心沉淀的处理细胞pelet中的组蛋白。 用移液枪头反复上下吸放混细胞,以利细胞破裂和组蛋白释放。然后没隔5分钟vortex一次。连续3-4次后与12000转离心5分钟。 取含有组蛋白的上清液。(组蛋白是碱性蛋白,在0.1N盐酸下带强正电荷而高度溶于水。 其他细胞蛋白基本因此变性而沉淀。这种萃取方法的总组蛋白纯度可达50%以上)。

3 )用移液枪在96孔板加80uL/well的0.2M的Na2CO3。 然后孔中加20uL在2)中萃取的组蛋白上清。要慢,防止CO2的突然冒出。于37度孵化30分钟。

4)倒掉孔中溶液,加100uL/well的1%BSA in PBSt。 封闭30分钟

5)用PBSt清洗well 4次, 加入0.25 ug/mL的抗乙酰赖氨酸抗体HRP标记(用1%BSA in PBSt稀释)于室温孵化30分钟。

6)倒掉孔中溶液,用PBSt清洗 4次。 然后加100uL/well的HRP底物TMB显色。组蛋白的乙酰化程度与颜色成正比。

抗乙酰化赖氨酸抗体HRP和TMB, 及各种乙酰化蛋白组学所需抗体及填料在国内的南宁蓝光生物技术(www.bl-biotech.com) 均有售。
2楼2012-03-26 10:55:21
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chlorella409

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以用各个组蛋白的序列直接做表达啊,那样的纯,另外测的话可以用LC-MS打质谱,我们公司有做成品的,如果你要成品的话联系我们
3楼2012-03-26 14:09:50
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