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ruthxu

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[求助] gromacs 中g_msd问题

gromacs 中用g_msd 计算扩散速率，为什么最后的曲线突然上升

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Betterlatethannever!

1楼 2012-02-22 13:26:38

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ruthxu

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引用回帖:

3楼: Originally posted by zhongyunxia at 2012-11-30 10:18:36
请教楼主，你的问题解决了吗？我现在也用g_msd计算扩散系数，我的是一个纯体系，命令是g_msd -f md.trr -s md.tpr -o msd.xvg 但是我看manual说扩散系数跟起始拟合点有很大关系，请教你是如何处理的，谢谢！

我拟合的时候是选择的中间一段，从100000ps到150000ps。