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panda73

金虫 (小有名气)


[资源] 给大家推荐一个很实用的工具:双酶切设计软件Double Digestion Designer

网上有一个在线的分子生物学工具,可以很方便的决心双酶切设计,可以精确的给出酶切时需要的酶量,而且能够推荐最合适的buffer。实用很方便,常用的几个限制性内切酶供应商的酶都能计算(包括NEB,Takara,MBI)。而且该软件还有限制性内切酶的搜索功能,可以利用酶的名字,识别序列,粘性末端序列等进行搜索,而且还可以搜索酶的完全同切酶(isoschizomer)和不完全同切酶(Neoschizomer)。即使是分子生物学高手,也可以用该软件辅助进行载体的设计和改造工作。
该软件界面和简单,使用方便。现在可以免费使用,用户名和密码都是test,大家可以收藏备用。以下是该工具的连接: http://www.bioinfomatics.cn/enzyme/login.php
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zjcgss

金虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

好东西,收藏啦!非常感谢!
31楼2012-03-28 16:09:10
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sd3824289

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

居然对来自不同供应商的两种酶都可以设计,推荐buffer,还真是很方便。
32楼2012-05-03 15:34:09
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shiliu2011

木虫 (正式写手)


网站提示:用户名或密码不正确
              User name or password incorrect!
33楼2012-05-08 09:18:06
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iceworld_008

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

我的也提示不正确。。。
34楼2012-08-27 16:51:16
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普通回帖

jinhx87

至尊木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

ding
2楼2012-02-21 07:10:30
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分子菜鸟

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好!正需要呢
3楼2012-02-21 08:42:40
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fangni

新虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶,顶,顶!谢谢分享
4楼2012-02-21 08:51:15
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geneqiang

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好帖,顶顶顶!
5楼2012-02-21 10:30:56
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panda73

金虫 (小有名气)


刚发现,该软件对在详细buffer信息栏中,还给出了很多酶的使用注意事项,真的的很强大。
希望大家都共享一下该工具的使用经验。
6楼2012-02-21 10:51:05
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rendy79

至尊木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢啊
7楼2012-02-21 11:38:03
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zdfang83

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好帖
8楼2012-02-21 12:31:43
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纸船

铜虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好,可惜没有PROMEGA公司的选项
9楼2012-02-21 16:26:56
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panda73

金虫 (小有名气)


该软件还能进行同尾酶搜素,以及完全同切酶和不完全同切酶搜素,的确方便了载体的改造和设计
10楼2012-02-21 22:34:17
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lw19850128

银虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持一下~很好用
11楼2012-02-22 13:31:39
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zy_696969

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

刚好需要,O(∩_∩)O谢谢
13楼2012-02-22 17:45:26
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bonbonzd

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

ding
14楼2012-02-22 18:53:06
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catq

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

If cutting 1ug plasmid DNA (3000bp) with PstI-HF and EcoRV-HF from NEB, and assumed recognition site for each enzyme is one, the needed PstI-HF is about 1.2U,and needed EcoRV-HF is about 1.5U.So lots of enzyme will be wasted if you follow the enzyme user manual to add 1ul(10-20U/ul) while cutting 1ug DNA.

貌似能省好多,有谁试过吗?
15楼2012-02-22 21:00:11
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panda73

金虫 (小有名气)


今天用DDDesigner设计了一个双酶切,发现EcoRV和NheI的酶用量居然差了近20倍。
16楼2012-02-23 21:38:35
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JASON13

银虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

登不上去啦,求助。。。
17楼2012-02-24 17:40:11
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panda73

金虫 (小有名气)


你再试试,登陆没问题呀,我现在几乎天天都在用,的确很实用
18楼2012-02-25 21:00:30
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812951300

新虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢啊
很有爱
19楼2012-02-25 22:29:27
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panda73

金虫 (小有名气)


居然还有中文版,还真是不错
20楼2012-02-27 21:51:33
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酶切专家

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

可以查找同粘酶的功能还是很好用的,在设计一些复杂的克隆方案时就方便很多了
21楼2012-02-28 10:53:08
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812951300

新虫 (初入文坛)


怎么进不去了 啊
22楼2012-02-29 10:44:31
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酶切专家

金虫 (小有名气)


我每次都能登录,没问题呀。
只是奇怪,这么好用的工具贴,为什么总是沉底呢?
强烈建议置顶几天。
23楼2012-03-01 21:29:10
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catq

新虫 (初入文坛)


没问题,我能进。
24楼2012-03-01 22:07:35
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purple~sky

铜虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢,不错呢
25楼2012-03-02 10:18:21
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panda73

金虫 (小有名气)


其中的DDDcase还是很有指导意义,大家可以看看
26楼2012-03-04 20:55:09
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酶切专家

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
居然对来自不同供应商的两种酶都可以设计,推荐buffer,还真是很方便。
现在可以申请免费试用,大家如果有兴趣,千万别错过
27楼2012-03-05 21:53:04
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ffllshz

银虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

不能使用??
28楼2012-03-18 19:39:07
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wangcongxs

银虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

怎么登陆不进去啊?
30楼2012-03-28 10:55:26
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duxing0101

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

急需,但是换了三个浏览器都登不上去,望赐教?
35楼2013-06-26 20:45:49
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yuanuancao

木虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

同样登录不上去呀,是同时有人登陆的问题?
36楼2013-06-28 14:40:30
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panda73

金虫 (小有名气)


引用回帖:
36楼: Originally posted by yuanuancao at 2013-06-28 14:40:30
同样登录不上去呀,是同时有人登陆的问题?

你可以申请试用,试用期可能是2周
37楼2013-06-28 18:21:51
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李小坦儿

铜虫 (小有名气)


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e 怎么打不开呢
38楼2013-12-17 11:12:27
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mu6mian6126

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

太好了,这个,现在就去哟个
39楼2015-02-11 11:36:46
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开火车撞地铁

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
39楼: Originally posted by mu6mian6126 at 2015-02-11 11:36:46
太好了,这个,现在就去哟个

为什么我进不去
40楼2015-05-12 09:14:08
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伦的爱

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

请问谁知道用该软件如何设计部分酶切?
41楼2015-06-14 21:27:29
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)


密码不对啊
42楼2016-11-27 22:05:36
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简单回复
shiliu201112楼
2012-02-22 16:46   回复  
五星好评  
立言29楼
2012-03-18 22:13   回复  
三星好评  
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