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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 怎样在DMol3 结构优化中使构型基本保持不变？
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lzn_t

木虫 (小有名气)

[求助] 怎样在DMol3 结构优化中使构型基本保持不变？

现已知同一物质存在两种不同结构a和b，已知晶胞(supercell)在不带电荷时a结构更为稳定；带有+1电荷时b更稳定。问题是：b结构的supercell在电中性下优化所得结果会变为a结构的supercell，但我需要得到b构型在电中性时的最优supercell，该如何实现？

[ Last edited by lzn_t on 2012-2-20 at 17:37 ]
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1楼2012-02-20 17:34:48
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lzn_t

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by souledge at 2012-02-20 22:07:37:
不知道LZ对于“基本构型”的理解是怎样的，这个词汇很暧昧，很难量化表示。
如果说是比例尺一样放大缩小，但各原子之间的空间对称关系保持不变，可以用分数坐标固定；如果说要各原子的绝对距离都不变，就要迪卡尔 ...

见4L
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6楼2012-02-21 12:55:29
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1006094470

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-21 08:33:54
把所有原子选上，然后modify-constraints可不可以？
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2楼2012-02-20 21:51:45
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-21 08:34:11
不知道LZ对于“基本构型”的理解是怎样的，这个词汇很暧昧，很难量化表示。
如果说是比例尺一样放大缩小，但各原子之间的空间对称关系保持不变，可以用分数坐标固定；如果说要各原子的绝对距离都不变，就要迪卡尔坐标固定。
相应的，还有在某轴向上固定其他轴向上变动之类的。
如果LZ想要的是，可以稍微构造变化一点，但是不要变化太多。比如正方体变成底比高为100:99的四方也可以接受，但是如果变成了不一定什么样子的结构就不能接受的话，那LZ就对电脑的智能期待太高了，或者，LZ的行为已经类似于“向着自己想要的结果上取优化”，从而与造结果没什么区别了……
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思想重于技巧，内涵重于表象
3楼2012-02-20 22:07:37
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yadong80

铜虫 (小有名气)
WDD880227(金币+1): 感谢交流 2012-02-21 08:34:25
结构优化的原则应该是尊重实验结构，也就是优化后的结构与优化前的结构（实验结构）越接近越好，如果出入太大，就得检查优化的设置，或则程序本身了。如果真如楼主所说，结构优化能够产生这样大的结构调整，楼主应该检查一下设置了。
PS: 个人觉得，楼主的描述是在考察我们的思辨能力，a和b是同一物质，已经说明a的supercell在电中性时最稳定，b的supercell在带一个单位电荷时最稳定，那么在电中性条件下优化b的supercell，得到a的supercell有什么好奇怪的？我想程序想告诉你a的supercell就是电中性条件下b的最优supercell
楼主最好说的具体点，a和b的差异是什么？
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4楼2012-02-20 23:16:44
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