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ashikai

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[求助] 关于pdb文件

各位大侠，我从PDB上下了一个蛋白文件 1rh2，但各种模拟软件均只显示原子，没有键（见下图），这是怎么回事啊？

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1楼 2012-02-14 23:12:16

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yyuan8658

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【答案】应助回帖

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jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-02-15 19:12:46
ashikai(金币+10): ★有帮助 2012-02-15 21:58:38

因为PDB文件里只有alpha-C原子的坐标

2楼2012-02-15 18:22:55

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ashikai

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引用回帖:

楼: Originally posted by yyuan8658 at 2012-02-15 18:22:55:
因为PDB文件里只有alpha-C原子的坐标

谢谢!
那能修复吗？或者有什么别的办法？我是学医的，这方面刚刚涉及。

3楼2012-02-15 21:57:46

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shiyiwenren

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御剑江湖(金币+4): 谢谢 2012-02-17 21:46:01

我用materials studio打开PDB文件后，对于文件中的结构的键用MS工具栏上的自动计算键之后，软件就会自动把键链接起来的，可能中间有些键会有错误，进行修改一下就可以了

4楼2012-02-16 08:52:47

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yyuan8658

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御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 21:46:09

PDB文件中只有alpha-C原子的坐标，即使能修复，准确性也不会高的。

5楼2012-02-16 10:19:13

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