24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1385  |  回复: 4

ayaya007

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教如何找内含子,求教高手,急!!

现在已知番茄中一个基因的cDNA序列,但是NCBI上没有登录号,我想设计跨内含子引物做RT-PCR,该品种刚刚被测序,我是否需要把cDNA与基因组DNA比对,然后找出内含子部分,在其两侧设计上下游引物呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaxinfish

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jhu132llh(金币+2): 鼓励积极参与讨论 2011-12-29 10:24:31
最保险的方法是用cDNA的2端设引物,用基因组DNA扩,测序,看有没有intron,说不定还没有,现在很多基因都没有intron
2楼2011-12-26 21:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xubo7

木虫之王 (文坛精英)

小木虫


jhu132llh(金币+1): 鼓励积极参与讨论 2011-12-30 16:46:12
虽然不太懂,但是觉得想法应该是正确的,比对后多余的就是内含子,这样做后RT结果也理想的话,那发文章的时候也比较有底气。
人的品德很重要!!!不能失去德行!!!
3楼2011-12-30 09:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dkoo1jxau

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jhu132llh(金币+3): 鼓励积极参与讨论 2011-12-30 16:46:26
可以先跟基因组的DNA草图序列比对,然后根据比对结果再来设计RT-pcr的引物,成功率比较高,而且有说服力。但是最好能跟其它的EST序列一起进行比对,这样能够更好的说明你对实验考虑的更周到。
4楼2011-12-30 15:05:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永远不知道

至尊木虫 (著名写手)

金花家族创始人

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同意1L的说法,4L的也较好
5楼2012-03-02 18:35:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ayaya007 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿2110,化学学硕310分,本科重点双非求调剂 +18 努力奋斗112 2026-04-08 18/900 2026-04-09 23:28 by wolf97
[考研] 283求调剂,工科! +8 苏打水7777 2026-04-08 8/400 2026-04-09 20:50 by xujun0624
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +17 努力奋斗112 2026-04-04 17/850 2026-04-09 20:35 by maddjdld
[考研] 266求调剂 +25 阳阳哇塞 2026-04-07 25/1250 2026-04-09 20:32 by only周
[考研] 计算机11408,286分求调剂 +9 木子念晞 2026-04-05 9/450 2026-04-09 20:04 by vgtyfty
[考研] 312求调剂 +3 李鸿飞飞 2026-04-06 3/150 2026-04-09 17:32 by wp06
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +19 慕绝cc 2026-04-09 23/1150 2026-04-09 17:14 by 段伟艳
[考研] 314求调剂 +20 wakeluofu 2026-04-09 21/1050 2026-04-09 16:14 by zhuimr
[考研] 311求调剂 +6 surte 2026-04-08 13/650 2026-04-09 14:00 by surte
[考研] 265求调剂 +19 小木虫085600 2026-04-06 21/1050 2026-04-08 10:38 by 逆水乘风
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
[考研] 283分求调剂 +14 试试看呗 2026-04-04 14/700 2026-04-08 07:03 by lijunpoly
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +11 大火山小火山 2026-04-05 11/550 2026-04-06 22:55 by yunlongyang
[考研] 362求调剂一志愿中国石油大学 +4 我要考大 2026-04-06 6/300 2026-04-06 14:11 by 无际的草原
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358求调剂 +4 cs0106 2026-04-04 4/200 2026-04-05 18:46 by imissbao
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:08 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿南农090401,268,求调剂 +5 一木鸟然 2026-04-04 5/250 2026-04-04 17:07 by babysonlkd
[考研] 272求调剂 +4 松柏常青5 2026-04-03 4/200 2026-04-04 17:03 by babysonlkd
[考研] 274求调剂 +9 顺理成张 2026-04-03 10/500 2026-04-03 15:10 by 啊俊!
信息提示
请填处理意见