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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 同一用户下 安装g03 g09 结果还是不行 混乱了
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

[交流] 同一用户下 安装g03 g09 结果还是不行 混乱了



尽管设置了不同的变量神码的  


# .bashrc

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

# User specific aliases and functions
# for Gaussian.03.E01
G03ROOT=/home/yin/g03
GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT
GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g03
LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
PATH=$G03ROOT/:$PATH
export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH

# for Gaussian.09.A01
# G09ROOT=/home/yin/g09
# GAUSS_EXEDIR=$G09ROOT
# GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g09
# LD_LIBRARY_PATH=$G09ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
# PATH=$G09ROOT/:$PATH
# export G09ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH


看上面代码部分   只用03  我就把09前面加上#    就像上面的  只用09了就把03前面加#  09前面的#去掉


我在想  是不是可以用两个用户？

两个用户的话  如果我在user1里面提交任务  然后切换到user2  再提交任务
user1里面的任务还在运行吗？  不太懂linux的多用户
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1楼 2011-12-26 18:34:09
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 21:28:45:
你可以写个小脚本，把里面的内容分别改成03 09啥的，就能各自运行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $ ...

非常感谢

对了 你这个脚本我用了  很好 不过就是运行脚本后也是一直等到任务算完  才会跳出新的$命令行  有啥办法修改吗？

[ Last edited by nyzhaoyin on 2011-12-27 at 00:30 ]
赞一下 回复此楼
5楼2011-12-26 23:56:31
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coolrainbow

木虫 (著名写手)
★
nyzhaoyin(金币+1):谢谢参与
你就非得写到.bashrc里啊，写个脚本在子shell里就行了
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-12-26 20:04:10
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 20:04:10:
你就非得写到.bashrc里啊，写个脚本在子shell里就行了

求具体指点  谢谢
回复此楼
3楼2011-12-26 20:13:50
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coolrainbow

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by nyzhaoyin at 2011-12-26 20:13:50:
求具体指点  谢谢

你可以写个小脚本，把里面的内容分别改成03 09啥的，就能各自运行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $g03root/g03/bsd/g03.profile
cd your_path
g03 < $1 > $2
rm -rf /tmp/${PBS_JOBID}

比如叫a.gjf，输出b.out，可以运行： ./rung03 a.gjf b.out
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4楼2011-12-26 21:28:45
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