版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

应助: 27 (小学生)
金币: 1044.9
帖子: 681
在线: 241.5小时
虫号: 563016

[交流] 同一用户下安装g03 g09 结果还是不行混乱了

尽管设置了不同的变量神码的

# .bashrc

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
      . /etc/bashrc
fi

# User specific aliases and functions
# for Gaussian.03.E01
G03ROOT=/home/yin/g03
GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT
GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g03
LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
PATH=$G03ROOT/:$PATH
export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH

# for Gaussian.09.A01
# G09ROOT=/home/yin/g09
# GAUSS_EXEDIR=$G09ROOT
# GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g09
# LD_LIBRARY_PATH=$G09ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
# PATH=$G09ROOT/:$PATH
# export G09ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH

看上面代码部分

只用03 我就把09前面加上# 就像上面的只用09了就把03前面加# 09前面的#去掉

我在想  是不是可以用两个用户？

两个用户的话  如果我在user1里面提交任务  然后切换到user2  再提交任务
user1里面的任务还在运行吗？  不太懂linux的多用户

回复此楼

» 猜你喜欢

小木虫的论文辅导靠谱吗？有没有用过的同学？已经有1人回复
QE计算声子ph.out的Γ点出现虚频（-30cm-1）vasp计算没有已经有0人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有142人回复
40-50万/年，中国散裂中子源诚聘计算模拟方向博士后已经有81人回复
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship 已经有0人回复
书籍求助：汽车市场营销理论与实务（电子版）——章小平已经有0人回复
东方理-中科大联合博士生招聘已经有0人回复
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生已经有11人回复
钴酸锂半电池小倍率容量上不去已经有1人回复
吉林大学材料物理本科生求问调剂信息已经有23人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

G03中的(Polarized solute)-Solvent 的值在G09中怎么找到已经有10人回复
g03 or g09 临时文件存放问题已经有7人回复
PBS脚本提交后Error 已经有11人回复
如何在计算机群上安装G09 已经有9人回复
求问 g09的 bashrc怎么写已经有18人回复
g09提交不了作业已经有7人回复
g09与g03的安装已经有9人回复
【求助】同一个结构，G09和G03 opt计算的能量差别大吗？已经有7人回复
【求助】G03和G09中TDDFT计算激发态的不同，请大伙指点一些已经有5人回复
【讨论】同时安装g03与g09 已经有9人回复
【求助】关于g09和g03的formchk和unfchk问题已经有11人回复
【求助】能同时在linux系统下安装g09和g03吗？已经有14人回复
【求助】formchk出错已经有23人回复
【讨论】根据你的使用，G09比G03到底有哪些改进。已经有9人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-12-26 18:34:09

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

★
nyzhaoyin(金币+1):谢谢参与

你就非得写到.bashrc里啊，写个脚本在子shell里就行了

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2011-12-26 20:04:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

应助: 27 (小学生)
金币: 1044.9
帖子: 681
在线: 241.5小时
虫号: 563016

引用回帖:

2楼: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 20:04:10:
你就非得写到.bashrc里啊，写个脚本在子shell里就行了

求具体指点谢谢

回复此楼

3楼2011-12-26 20:13:50

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

3楼: Originally posted by nyzhaoyin at 2011-12-26 20:13:50:
求具体指点谢谢

你可以写个小脚本，把里面的内容分别改成03 09啥的，就能各自运行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $g03root/g03/bsd/g03.profile
cd your_path
g03 < $1 > $2
rm -rf /tmp/${PBS_JOBID}

比如叫a.gjf，输出b.out，可以运行： ./rung03 a.gjf b.out

赞一下(1人)

回复此楼

4楼2011-12-26 21:28:45

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

应助: 27 (小学生)
金币: 1044.9
帖子: 681
在线: 241.5小时
虫号: 563016

引用回帖:

4楼: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 21:28:45:
你可以写个小脚本，把里面的内容分别改成03 09啥的，就能各自运行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $ ...

非常感谢

对了你这个脚本我用了很好不过就是运行脚本后也是一直等到任务算完才会跳出新的$命令行有啥办法修改吗？

[ Last edited by nyzhaoyin on 2011-12-27 at 00:30 ]

赞一下

回复此楼

5楼2011-12-26 23:56:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

g03 < $1 > $2 &

回复此楼

6楼2011-12-27 08:24:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nyzhaoyin

新虫 (正式写手)

应助: 27 (小学生)
金币: 1044.9
帖子: 681
在线: 241.5小时
虫号: 563016

引用回帖:

6楼: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-27 08:24:41:
g03 < $1 > $2 &

加上&后出错了。。。。

03 出现：

forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 11, file /tmp/test2/Gau-8114.inp
Image             PC             Routine          Line       Source
g03             00000000004AED6E  Unknown             Unknown  Unknown
g03             00000000004ADF6A  Unknown             Unknown  Unknown
g03             00000000004446AA  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000418E6A  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000418476  Unknown             Unknown  Unknown
g03             000000000042BB8E  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000405C29  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000404C02  Unknown             Unknown  Unknown
libc.so.6       0000003C8AA1ECDD  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000404B29  Unknown             Unknown  Unknown

09出现：

PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /tmp/test/Gau-8120.inp
In source file ml0.f, at line number 182

去掉&都正常了

赞一下

回复此楼

7楼2011-12-27 12:00:00

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖