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flytime1115

铜虫 (初入文坛)

[求助] 有木有人做过Taqman 探针法Real-Time?? 已有1人参与

我要检测基因组中插入的某个外源片段的拷贝数,需要做绝对定量。师兄建议不要用sybr 燃料做,建议用探针法做。现在毫无头绪,不知道怎么设计,怎么合成?望各位高人指点一下……
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sandisk411

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
单拷贝就是染色体上只有1处有外源基因。遗传背景这个词可能不是很好,容易让人混淆。我举个T-DNA转基因水稻吧,比如是转基因出来的当代是T0代水稻,其自交获得的下一代就是T1代,以此类推就是T2代,T3代.......。
在T0代时就检测拷贝数是最方便解释的,因为T-DNA框只在1条同源染色体上插入,所以插入目的基因与参考基因(基因组里单拷贝)的比值应是1:2;双拷贝的,就该是1:1;
如果是T1代的苗,比值是1:1的话,可能是单拷贝插入株的纯合植株,也可能是双拷贝植株的杂合株了。
所以,你需要知道你的材料是种植第几代了,是否是所谓的纯合了。我不知道你做的是什么材料,是水稻的话,做SOURTHERN不难的。
19楼2011-12-26 08:18:25
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
设计引物探针,构建质粒,定量
2楼2011-12-22 16:45:28
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shaquila

金虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-12-22 18:29:07
楼主做的是专基因检测吗?如果是,那不建议用荧光定量,主流的方法用SOUTHERN杂交。TAQMAN可以让公司设计合成,sybr法也能做,两种方法没有质变
3楼2011-12-22 18:04:14
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flytime1115

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
楼: Originally posted by shaquila at 2011-12-22 18:04:14:
楼主做的是专基因检测吗?如果是,那不建议用荧光定量,主流的方法用SOUTHERN杂交。TAQMAN可以让公司设计合成,sybr法也能做,两种方法没有质变

是做转基因检测,southern杂交在做,可是无法确定拷贝数,仅仅根据灰度值判断,觉得不太靠谱
4楼2011-12-22 19:37:05
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