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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求助如何选择建发育树的菌种
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good! 2011-12-24 15:11:48
smisuccess(金币+10): ★★★很有帮助 2011-12-26 09:46:26
你做比对肯定希望确定该菌株的种属对吧。所以在选择序列的时候应该找一些确定了属名和种名的菌株序列，每种找两个就好了。一般以sp.结尾的这种菌株序列不要下载。相似度低的也要选择一些，这样做出来的树会更明了，当然这样也并不会影响到你的最终结果。模式菌株可以到论文里面去查找，然后通过名称或者登录号到Genbank去搜索。
赞一下(1人) 回复此楼
勤奋、执着、专注，则无坚不破。
2楼2011-12-24 09:20:06
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