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tuobaohua

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[交流] 【求助/交流】MEGA构建发育树疑问 已有3人参与

这两天用Mega做进化树,在粘贴序列时遇到一个问题:最后进行比对时,会弹出错误对话框:Error#4526:Invalid base found:8(in line 8)
检查了这一行的序列:
ATTGAACGCTGGCGGCAGG-CCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAGCACAGAGAGCTTGC
80TCTCGGGTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCTGATGGAGG
GGG 140ATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGG
GGGACCT 200TCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTG
第八行就是上面四行中的第二行,我用斜体标示出来了。哪位高手帮忙看看这是怎么回事啊?
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glidingwater

银虫 (小有名气)

tuobaohua(金币+1):啊,那么多序列,每个都是这样,我要删到何时啊?晕了晕了晕了 2010-08-24 08:20:44
tuobaohua(金币+3): 2010-12-19 18:51:17
建议删除相应的数字及非碱基缩写字母
如果社会的黑暗侵蚀了学府,我该往何处?
2楼2010-08-23 19:57:23
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欣晴5832

金虫 (小有名气)

tuobaohua(金币+1):因为从NCBI中拷出来就会有数字啊,然后用clustal x进行“掐头去尾”处理后还是有数字 2010-08-24 12:39:40
tuobaohua(金币+2): 2010-12-19 18:51:12
同意楼上的说法,可是为什么会出现那么多数字呢?
3楼2010-08-24 10:29:34
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欣晴5832

金虫 (小有名气)

tuobaohua(金币+1):问题不是这个 2010-08-24 12:33:11
tuobaohua(金币+2): 2010-12-19 18:51:06
上面英文提示的8就是那八个数字
4楼2010-08-24 10:30:45
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silicare

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tuobaohua(金币+1):谢谢,我是半路出家的和尚,多向大家讨教了 2010-08-24 12:32:53
tuobaohua(金币+4): 2010-12-19 18:51:02
用DNAMAN转换一下就可以去掉数字了,
5楼2010-08-24 12:07:56
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悄悄的俺走了

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我用mega做进化树是出现这样的错误提示:invalid base found:U,该怎么进行下去呢,用的是蛋白质序列啊,U表示硒半胱氨酸
6楼2012-05-30 21:27:37
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lidonghong

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wizardfan: 金币+3, 鼓励新虫发帖 2012-08-28 06:52:50
内容已删除
生物化学与分子生物学
7楼2012-08-27 11:51:07
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by lidonghong at 2012-08-27 11:51:07
你这序列是直接从genebank里下载出来的,含有数字序号,最好用软件如primer5.0去除数字后在转进mega中即可

为什么转换之后还是出现这种错误啊?
8楼2013-04-26 21:42:33
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lidonghong

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by yuguiyan at 2013-04-26 21:42:33
为什么转换之后还是出现这种错误啊?...

能把你的比对结果 截几个图看看不
生物化学与分子生物学
9楼2013-04-27 08:27:04
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tuobaohua

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谢谢了,都已经3年前的帖子了
10楼2013-04-27 21:46:35
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