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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】MEGA构建发育树疑问
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tuobaohua

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[交流] 【求助/交流】MEGA构建发育树疑问 已有3人参与

这两天用Mega做进化树，在粘贴序列时遇到一个问题：最后进行比对时，会弹出错误对话框：Error#4526:Invalid base found：8（in line 8）
检查了这一行的序列：
ATTGAACGCTGGCGGCAGG-CCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAGCACAGAGAGCTTGC
80TCTCGGGTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCTGATGGAGG
GGG 140ATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGG
GGGACCT 200TCGGGCCTCTTGCCATCAGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTG
第八行就是上面四行中的第二行，我用斜体标示出来了。哪位高手帮忙看看这是怎么回事啊？
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1楼 2010-08-23 19:33:04
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glidingwater

银虫 (小有名气)
tuobaohua(金币+1):啊，那么多序列，每个都是这样，我要删到何时啊？晕了晕了晕了 2010-08-24 08:20:44
tuobaohua(金币+3): 2010-12-19 18:51:17
建议删除相应的数字及非碱基缩写字母
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如果社会的黑暗侵蚀了学府，我该往何处？
2楼2010-08-23 19:57:23
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
tuobaohua(金币+1):因为从NCBI中拷出来就会有数字啊，然后用clustal x进行“掐头去尾”处理后还是有数字 2010-08-24 12:39:40
tuobaohua(金币+2): 2010-12-19 18:51:12
同意楼上的说法，可是为什么会出现那么多数字呢？
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3楼2010-08-24 10:29:34
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
tuobaohua(金币+1):问题不是这个 2010-08-24 12:33:11
tuobaohua(金币+2): 2010-12-19 18:51:06
上面英文提示的8就是那八个数字
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4楼2010-08-24 10:30:45
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silicare

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tuobaohua(金币+1):谢谢，我是半路出家的和尚，多向大家讨教了 2010-08-24 12:32:53
tuobaohua(金币+4): 2010-12-19 18:51:02
用DNAMAN转换一下就可以去掉数字了，
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5楼2010-08-24 12:07:56
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悄悄的俺走了

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我用mega做进化树是出现这样的错误提示:invalid base found:U，该怎么进行下去呢，用的是蛋白质序列啊，U表示硒半胱氨酸
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6楼2012-05-30 21:27:37
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lidonghong

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+3, 鼓励新虫发帖 2012-08-28 06:52:50
内容已删除
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生物化学与分子生物学
7楼2012-08-27 11:51:07
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by lidonghong at 2012-08-27 11:51:07
你这序列是直接从genebank里下载出来的，含有数字序号，最好用软件如primer5.0去除数字后在转进mega中即可

为什么转换之后还是出现这种错误啊？
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8楼2013-04-26 21:42:33
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lidonghong

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by yuguiyan at 2013-04-26 21:42:33
为什么转换之后还是出现这种错误啊？...

能把你的比对结果 截几个图看看不
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生物化学与分子生物学
9楼2013-04-27 08:27:04
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tuobaohua

荣誉版主 (文坛精英)

投资理财发言人

优秀版主
谢谢了，都已经3年前的帖子了
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10楼2013-04-27 21:46:35
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