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da_da

金虫 (小有名气)

[交流] 融合蛋白的linker怎么设计

融合蛋白的linker怎么设计，大家讨论下啊
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1楼 2011-12-04 10:44:21
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bio830805

银虫 (小有名气)
★
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da_da(金币+2): 2011-12-06 09:03:11
http://www.ibi.vu.nl/programs/linkerdbwww/
我记得有这样类似的linker database的，你可以再看看。不过一般要做几个不同长度的linker，我自己没有做过，实验室有别的人做过的。
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charles08
11楼2011-12-06 00:03:59
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imyting

至尊木虫 (正式写手)
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da_da(金币+1): 2011-12-05 14:55:17
西瓜(金币+2): Good！ 2011-12-05 18:22:34
楼主是说两个蛋白通过linker连接在一起吧！？一般来说，linker应该要有比较大的柔性，比如连续几个Gly，两端使用Ala。
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5楼2011-12-04 15:29:44
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丫头7976

铜虫 (正式写手)
★
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你的两个融合蛋白多大呀，我也做过融合蛋白，都没有加linker
也表达了，没有做对比，不知道加linker和不加有什么区别
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7楼2011-12-05 10:56:17
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wapw1987

新虫 (小有名气)
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不加linker，就直接两个一起表达吗，那不就成一个蛋白了，若没特殊位点，还能切开吗？
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9楼2011-12-05 17:07:28
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123321hh

银虫 (小有名气)
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10楼: Originally posted by imyting at 2011-12-05 20:15:48:
如果是为了让两个蛋白一起表达的话，一般要求linker是柔性的，这样表达出来的两个蛋白就能保持原有的空间构象，也就是保持各自的活性。如果是要将两个蛋白连接在一起成为一个具有不同功能的新蛋白的话就比较麻烦 ...

你好，我也想做融合蛋白，但是不知道用什么软件模拟，也不太清楚做融合蛋白需要注意的情况，求赐教！
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12楼2012-02-21 09:38:58
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yuechangwu

银虫 (正式写手)
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引用回帖:
1楼: Originally posted by da_da at 2011-12-04 10:44:21:
融合蛋白的linker怎么设计，大家讨论下啊

你是求助还是发动讨论呢？
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2楼2011-12-04 12:46:00
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zhen_fang

银虫 (正式写手)
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首先搞明白什么叫融合蛋白
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4楼2011-12-04 13:28:46
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da_da

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by imyting at 2011-12-04 15:29:44:
楼主是说两个蛋白通过linker连接在一起吧！？一般来说，linker应该要有比较大的柔性，比如连续几个Gly，两端使用Ala。

是想通过linker把两个蛋白连接在一起，你能说具体点吗？选的时候有什么原则吗？柔性linker和刚性linker又是怎么回事啊
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6楼2011-12-04 18:37:21
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grape114

金虫 (正式写手)
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da_da(金币+1): 2011-12-05 14:55:30
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-12-05 18:22:55
我目前也做融合蛋白，我觉得要根据两个蛋白的性质和目的而定，加linker，是为了好表达，或者好纯化，也可能是增加药效。起码不能干扰你的蛋白的空间结构
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8楼2011-12-05 11:06:01
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imyting

至尊木虫 (正式写手)
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da_da(金币+2): 2011-12-05 20:47:46
引用回帖:
6楼: Originally posted by da_da at 2011-12-04 18:37:21:
是想通过linker把两个蛋白连接在一起，你能说具体点吗？选的时候有什么原则吗？柔性linker和刚性linker又是怎么回事啊

如果是为了让两个蛋白一起表达的话，一般要求linker是柔性的，这样表达出来的两个蛋白就能保持原有的空间构象，也就是保持各自的活性。如果是要将两个蛋白连接在一起成为一个具有不同功能的新蛋白的话就比较麻烦了，linker必须能使两个蛋白形成具有活性的构象。可以先通过计算机模拟一下，再进行具体设计。
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10楼2011-12-05 20:15:48
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charles08

铁杆木虫 (著名写手)
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送鲜花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by bio830805 at 2011-12-06 00:03:59
http://www.ibi.vu.nl/programs/linkerdbwww/
我记得有这样类似的linker database的，你可以再看看。不过一般要做几个不同长度的linker，我自己没有做过，实验室有别的人做过的。

这个站点提供的不错
还有其他资源吗？
我也在设计连接肽
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13楼2013-03-21 15:46:10
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charles08

铁杆木虫 (著名写手)
★
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引用回帖:
10楼: Originally posted by imyting at 2011-12-05 20:15:48
如果是为了让两个蛋白一起表达的话，一般要求linker是柔性的，这样表达出来的两个蛋白就能保持原有的空间构象，也就是保持各自的活性。如果是要将两个蛋白连接在一起成为一个具有不同功能的新蛋白的话就比较麻烦了 ...

一般用什么软件模拟，怎么设计
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14楼2013-11-06 14:26:38
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freeboygt

木虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by bio830805 at 2011-12-06 00:03:59
http://www.ibi.vu.nl/programs/linkerdbwww/
我记得有这样类似的linker database的，你可以再看看。不过一般要做几个不同长度的linker，我自己没有做过，实验室有别的人做过的。

你这个打不开呀
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15楼2017-09-10 21:26:11
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简单回复
zyxme3楼
2011-12-04 12:55   回复  
祝福
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