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MS金属氧化物表面吸附有机物平衡问题
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我用MS模拟金属氧化物表面吸附有机物分子时,切割一个表面,然后将有机分子用建层的方法放在表面,然后再加上0.3nm的真空层,盒子的尺寸为1.1*1.1*6.3nm,优化好结构后,再进行200ps的动力学模拟,温度为338K,NVT系综,可最后的输出文件中,温度上下波动有30K,能量波动有20kcal/mol左右 ,加大模拟时间也不能平衡 这是不是表示体系没有达到平衡状态,如何改才能平衡? 另外计算有机分子的RMSD,最后出没有成直线。 |
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beibeichem
铁虫 (小有名气)
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