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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » 【求助】如何用ME或者MS模拟 金属氧化物吸附有机分子？
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caijj09

木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】如何用ME或者MS模拟 金属氧化物吸附有机分子？

如何用ME或者MS模拟  金属氧化物吸附有机分子？

本人是分子模拟方面的菜鸟，只看过MS中文教程中模拟Pd(110)面吸附CO的模拟步骤，如果是有机分子呢？该怎么模拟？分子怎么构建？


求高手给出步骤！！！！（鼓励给出截图）

[ Last edited by caijj09 on 2011-1-4 at 19:57 ]
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1楼 2011-01-04 19:11:03
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linlin1011

铁虫 (正式写手)
★ ★
caijj09(金币+2):能说的更具体一点么？用MS的话，怎么构建有机分子？ 2011-01-05 20:05:28
ghcacj(金币+2):谢谢 2011-01-06 09:11:24
ME做起来比较费劲，既然楼主已经看过MS中的吸附例子，应该用MS好些。最主要的是要先优化有机物分子，然后导入金属氧化物，建立模拟模型，然后再进行优化。
期待更好的回答。
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2楼2011-01-05 08:33:27
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caijj09

木虫 (职业作家)
继续求助
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3楼2011-01-05 20:05:45
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linlin1011

铁虫 (正式写手)
★ ★ ★
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-06 09:11:34
caijj09(金币+5):谢谢啦！ 2011-01-07 16:57:28
最省事的方法是查你研究有机分子的现成结构式，许多化学试剂公司提供，有键长、键角等信息。还有看别人发表的文献中也有。
没有的话，只有从最接近的已知有机分子开始用置换、替代来变成你的有机分子，然后再优化结构，使能量最低，得到稳定构型。
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4楼2011-01-06 08:34:36
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caijj09

木虫 (职业作家)
继续求助
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5楼2011-01-07 16:57:37
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