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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS金属氧化物表面吸附有机物平衡问题
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meiqingqing

新虫 (初入文坛)

[求助] MS金属氧化物表面吸附有机物平衡问题

我用MS模拟金属氧化物表面吸附有机物分子时，切割一个表面，然后将有机分子用建层的方法放在表面，然后再加上0.3nm的真空层，盒子的尺寸为1.1*1.1*6.3nm，优化好结构后，再进行200ps的动力学模拟，温度为338K，NVT系综，可最后的输出文件中，温度上下波动有30K，能量波动有20kcal/mol左右
，加大模拟时间也不能平衡
这是不是表示体系没有达到平衡状态，如何改才能平衡？
另外计算有机分子的RMSD，最后出没有成直线。
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1楼 2011-11-23 18:42:45
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meiqingqing

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by beibeichem at 2011-11-25 10:48:26:
你好，想向你请教一些关于聚合物在表面吸附的问题 有QQ吗

我也不太懂，所以才求助，只能是互相探讨，我给你我的邮箱吧
meiqing0406206@163.com，
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3楼2011-11-25 11:13:58
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beibeichem

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

meiqingqing(金币+1): 2011-11-25 11:16:22
你好，想向你请教一些关于聚合物在表面吸附的问题 有QQ吗
赞一下 回复此楼
2楼2011-11-25 10:48:26
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clapham

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 鼓励交流 2012-01-04 19:23:26
meiqingqing(金币+9): ★有帮助 2012-03-08 15:56:37
你用的是那个模块来做的！没有具体的模块怎么帮你哦！
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4楼2012-01-01 14:09:15
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meiqingqing

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by clapham at 2012-01-01 14:09:15:
你用的是那个模块来做的！没有具体的模块怎么帮你哦！

我用的是Discover，做动力学方面。Forcite发现也能做这些方面的。你有这些金属表面吸附改性剂或有机小分子的外文文献吗？
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5楼2012-02-20 16:22:14
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