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MS金属氧化物表面吸附有机物平衡问题
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我用MS模拟金属氧化物表面吸附有机物分子时，切割一个表面，然后将有机分子用建层的方法放在表面，然后再加上0.3nm的真空层，盒子的尺寸为1.1*1.1*6.3nm，优化好结构后，再进行200ps的动力学模拟，温度为338K，NVT系综，可最后的输出文件中，温度上下波动有30K，能量波动有20kcal/mol左右 ，加大模拟时间也不能平衡 这是不是表示体系没有达到平衡状态，如何改才能平衡？ 另外计算有机分子的RMSD，最后出没有成直线。 |
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beibeichem
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