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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 我的测序结果显示多出一个碱基来 整个编码序列的碱基数就不是3的倍数了
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etandy

铁虫 (初入文坛)

[求助] 我的测序结果显示多出一个碱基来 整个编码序列的碱基数就不是3的倍数了

各位虫虫，小弟刚涉及这方面的实验，将PCR产物连接了T载体，然后去测序，模板序列是783bp，测序结果多出一个碱基来，成了784bp了，我该怎么办
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1楼 2011-11-21 23:58:36
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

不想打击你，不过很有可能是PCR时产生突变了……
可以另外挑个单菌落，再测一次，正确了最好，如果还是这种情况，考虑下楼上的吧。
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5楼2011-11-23 21:07:53
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-11-23 21:05:53
把峰图拿出来看，有的时候两个连续一样的碱基会测成三个峰，其中有一个是杂峰要去掉！
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-11-22 11:04:07
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etandy

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by etandy at 2011-11-21 23:58:36:
各位虫虫，小弟刚涉及这方面的实验，将PCR产物连接了T载体，然后去测序，模板序列是783bp，测序结果多出一个碱基来，成了784bp了，我该怎么办

下面是我的峰图，位置在128-130bp。明显是3个G，理应是2个G。
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3楼2011-11-23 10:15:36
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howbigpig

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-11-23 21:06:12
楼主有没有考虑多了一个碱基有可能是个inDel类型的SNP？
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4楼2011-11-23 16:47:16
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