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xiangquanju

金虫 (小有名气)

[求助] 做过用同源重组进行基因敲出的朋友请进,PCR做不出来!!

利用同源重组的原理,打算敲掉大肠杆菌的一个基因,以pKD4为模板,打算扩增一段带有卡那霉素抗性基因的片段,作为重组筛选的标记。
上下游引物均有70bp,其中20bp是和质粒模板互补的,其余50bp是和基因组上欲敲除的基因互补的。与质粒互补的20bp,Tm值分别为47和60,PCR一直都只有引物带,退火温度从30--50度都试过了,也尝试了pfu和KOD聚合酶,都没什么改进
所以恳请做过类似实验的虫友指点指点
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xiaoxiang5

银虫 (正式写手)

KOD
条件:
94 2min   
98 20sec 54 30sec 68  1.5min  40cycles
4 forever
你试下这个条件,呵呵。
11楼2012-03-13 10:32:57
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