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nnipp

金虫 (小有名气)

[求助] 求.XYZ 文件获得任意原子距离工具

刚开始学习分子动力学
如何从.XYZ 文件获得任意原子距离
各位大侠有现成的小工具吗?
悲催,不会编程=。=“
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功不唐捐
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qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-16 16:53:27
用VMD量一下就好了.
Life, Love, Laugh.
2楼2011-11-16 13:25:00
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qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-19 11:27:37
引用回帖:
5楼: Originally posted by nnipp at 2011-11-17 21:38:28:
amber 可以用 ptraj命令自动测量并输出两原子之间距离吗?
CPMD或者CP2K的.xyz文件可以直接读取吗?非常感谢!

不管这是不是你的课题的主体, 我觉得你还是要写一个小程序来实现这个.
Life, Love, Laugh.
6楼2011-11-18 06:36:12
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