[求助] 求.XYZ 文件获得任意原子距离工具

2楼: Originally posted by qphll at 2011-11-16 13:25:00:
用VMD量一下就好了.

4楼: Originally posted by yyuan8658 at 2011-11-17 09:00:32:
如果你用的是amber的话，有ptraj命令用来测量的。
其它软件我不熟悉，貌似也应该会有的。

6楼: Originally posted by qphll at 2011-11-18 06:36:12:
不管这是不是你的课题的主体,　我觉得你还是要写一个小程序来实现这个.

8楼: Originally posted by q1036210267 at 2011-11-19 08:52:57:
用fortran 很简单的编程， 就是先把 xyz 文件读入,
例如有两个原子坐标分别为（x1, y1, z1）和 (x2, y2, z2)
用d = sqrt ( （x1- x2）**2 + (y1-y2)**2 + (z1-z2)**2 )，也就是数学上计算三维空间上两个 点之间 ...

10楼: Originally posted by q1036210267 at 2011-11-20 22:29:52:
首先定义：你要操作的文件名为 1
open（1，file = 你的文件名+格式名）
然后读取数据： read（1，*）
然后对数据进行 操作。  

这中间我省略了很多步骤，你看下Fortran 书，就可以求出距离了。