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kingfz

新虫 (初入文坛)

[求助] gromacs 试运行错误

我是gromacs新手
在ubuntu下安装成功后,试运行自带tutor中getting started speptide中的例子
进入speptide目录后,运行pdb2gmx命令,结果出现file input/output error spedtide。pdb
source code fole :/build/buildd/gromacs-4.5.3/src/gmxlib/futil.c, line:491
是不是我gmxlib变量没设置好,软件认不到pdb文件。
我已经进入tutor/speptide目录中。
这个问题困扰我5天了,希望高手能帮帮我这个新人
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-11-29 12:05:19
我自己电脑上也是ubuntu 上装的gromacs ,你按照手册上介绍的,安装好了之后有没有出现名言?
你试试别的命令,或者试试别的pdb文件看看能不能找到?
看你帖子里面“file input/output error spedtide。pdb ” ,如果你输入命令也是这样,那肯定就不对了,应该是 spedtide.pdb  。

同时也要确认输入的命令都是正确的
2楼2011-11-28 21:20:18
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