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heapyssb

木虫 (著名写手)

[求助] 关于NCBI中dbSNP数据库的问题,非常期待和感谢大家的回答

我在dbSNP数据库中搜索到了一些SNP序列,但看不懂是什么意思,比如:

rs16733773 [Gallus gallus]Links
>gnl|dbSNP|rs16733773rs=16733773|pos=41|len=81|taxid=9031|mol="genomic"|class=snp|alleles="C/G"|build=128
GCTCCAATTG GAGATTTAGA GAGCAAAGGC ACTGCAAAAT
S
TGCTTTTTTC TTGAAAAAGC CTGTCTGCTG TGTTGCTCAG
序列中的S表示什么意思啊,还有就是究竟是那个位点发生了变异,序列说明中的alleles="C/G"又是代表什么意思啊?
希望大家能给予相关的解释啊,万分感激!!
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

heapyssb(金币+3): 2011-11-10 11:32:26
heapyssb(金币+3): 2011-11-10 11:34:30
S为strong,即为C/G的兼并写法;既然是SNP数据,即表示这个位点是C/G 的SNP
2楼2011-11-10 10:16:45
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

同理,A/T简写为W(weak)
3楼2011-11-10 10:17:12
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avhg

木虫 (著名写手)

幻象

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2011-11-10 10:16:45:
S为strong,即为C/G的兼并写法;既然是SNP数据,即表示这个位点是C/G 的SNP

请教下,为何前边的有的GC不是S标准呢?
只要坚持,胜利是迟早的事。
4楼2011-11-10 11:00:53
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heapyssb

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2011-11-10 10:16:45:
S为strong,即为C/G的兼并写法;既然是SNP数据,即表示这个位点是C/G 的SNP

在想问下,这个S和W的这些定义和简写在哪里有详细的解释啊
5楼2011-11-10 11:37:14
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