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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于NCBI中dbSNP数据库的问题，非常期待和感谢大家的回答
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heapyssb

木虫 (著名写手)

[求助] 关于NCBI中dbSNP数据库的问题，非常期待和感谢大家的回答

我在dbSNP数据库中搜索到了一些SNP序列，但看不懂是什么意思,比如：

rs16733773 [Gallus gallus]Links
>gnl|dbSNP|rs16733773rs=16733773|pos=41|len=81|taxid=9031|mol="genomic"|class=snp|alleles="C/G"|build=128
GCTCCAATTG GAGATTTAGA GAGCAAAGGC ACTGCAAAAT
S
TGCTTTTTTC TTGAAAAAGC CTGTCTGCTG TGTTGCTCAG
序列中的S表示什么意思啊，还有就是究竟是那个位点发生了变异，序列说明中的alleles="C/G"又是代表什么意思啊？
希望大家能给予相关的解释啊，万分感激！！
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1楼 2011-11-10 09:04:42
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

heapyssb(金币+3): 2011-11-10 11:32:26
heapyssb(金币+3): 2011-11-10 11:34:30
S为strong，即为C/G的兼并写法；既然是SNP数据，即表示这个位点是C/G 的SNP
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2楼2011-11-10 10:16:45
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

同理，A/T简写为W(weak)
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3楼2011-11-10 10:17:12
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avhg

木虫 (著名写手)

幻象
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2011-11-10 10:16:45:
S为strong，即为C/G的兼并写法；既然是SNP数据，即表示这个位点是C/G 的SNP

请教下，为何前边的有的GC不是S标准呢？
赞一下 回复此楼
只要坚持，胜利是迟早的事。
4楼2011-11-10 11:00:53
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heapyssb

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2011-11-10 10:16:45:
S为strong，即为C/G的兼并写法；既然是SNP数据，即表示这个位点是C/G 的SNP

在想问下，这个S和W的这些定义和简写在哪里有详细的解释啊
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5楼2011-11-10 11:37:14
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