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shiluslu

金虫 (正式写手)

[求助] 如何计算分子间的r.m.s. deviation 值

单晶中不对称单元中包含了两个分子,要求出这两个分子间的r.m.s. deviation 值,我该如何计算啊,采用什么软件呢?
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


帝夫(金币+1): 感谢回帖交流! 2011-11-06 21:24:06
什么叫两个分子间的?
应说明是距离? 平面夹角,氢键,还是别的?

是说的平面间夹角吗?
xi2004-emuch@163.com
2楼2011-11-04 15:08:17
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shiluslu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xi2004 at 2011-11-04 15:08:17:
什么叫两个分子间的?
应说明是距离? 平面夹角,氢键,还是别的?

是说的平面间夹角吗?

我的晶体中的一个不对称单元包含了两个分子(分子不是完全平面结构的),编辑说compare the conformation of both molecules, e.g. by fitting the two molecules and mentioning the rmsd.
,我不太明白编辑的意思,您认为了
努力,尽力,不放弃,要放轻松,心态很重要!
3楼2011-11-04 18:53:35
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