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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 综合其他 » 如何计算分子间的r.m.s. deviation 值
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shiluslu

金虫 (正式写手)

[求助] 如何计算分子间的r.m.s. deviation 值

单晶中不对称单元中包含了两个分子，要求出这两个分子间的r.m.s. deviation 值，我该如何计算啊，采用什么软件呢？
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1楼 2011-11-04 14:33:20
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
帝夫(金币+1): 感谢回帖交流！ 2011-11-06 21:24:06
什么叫两个分子间的？
应说明是距离？ 平面夹角，氢键，还是别的？

是说的平面间夹角吗？
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xi2004-emuch@163.com
2楼2011-11-04 15:08:17
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shiluslu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xi2004 at 2011-11-04 15:08:17:
什么叫两个分子间的？
应说明是距离？ 平面夹角，氢键，还是别的？

是说的平面间夹角吗？

我的晶体中的一个不对称单元包含了两个分子（分子不是完全平面结构的），编辑说compare the conformation of both molecules, e.g. by fitting the two molecules and mentioning the rmsd.
，我不太明白编辑的意思，您认为了
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3楼2011-11-04 18:53:35
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