24小时热门版块排行榜    

查看: 616  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

语逸

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于VASP共线与非共线计算任务提交的脚本问题

#!/bin/bash
#
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -l walltime=240:00:00
#PBS -N h0.5-1
#PBS -j oe
#PBS -V
# setup runfile
# setup workpath and go to work dir
export MPICHROOT=/opt/intel/impi/4.0.0.027/bin
export VASPROOT=/export/apps
export PATH=$PATH:$VASPROOT:$MPICHROOT:.
logfile=log
cd $PBS_O_WORKDIR
# Define number of processors
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
# output PBS info to result
rm -f ./result
echo ================= PBS info ==================== >>result
echo Working directory is $PBS_O_WORKDIR >>result
echo Running on host `hostname` >>result
echo Directory is `pwd` >>result
echo This jobs runs on the following processors: >>result
echo `cat $PBS_NODEFILE` >>result
echo This job has allocated $NPROCS nodes >>result
echo  ********************************************** * >>result
echo  Start Time is `date` >>result
echo  ************************************************>>result
$MPICHROOT/mpirun -r ssh -v -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS $VASPROOT/vasp_nocoliear  > $logfile
echo ================================================ >>result
echo  ************************************************>>result
echo End Time is `date` >>result
echo  ************************************************>>result


用非共线算时需要设置$VASPROOT/vasp_nocoliear  > $logfile
共线算时是$VASPROOT/vasp_mpi> $logfile
我算了共线的但是脚本都用了非共线的设置。。。这样可以吗?请大家帮帮忙
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

语逸

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chongjing123 at 2011-11-01 19:03:22:
没影响吧,不会报错
自己做个测试,

算非共线用了共线的设置肯定出错  

倒是没有报错,因为之前算共线都用了算非共线的脚本。。。在想是不是可以,主要是不大懂vasp.pbs脚本后面shell脚本,所以不敢确定可不可行,要是不行,前面的工作都。。。下午我蛮改了之前的几个任务中的脚本用了共线的,两个居然算死了,其他结果还没出来,好纠结啊
3楼2011-11-01 22:22:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

chongjing123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

语逸(金币+2): 2011-11-18 08:48:43
没影响吧,不会报错
自己做个测试,

算非共线用了共线的设置肯定出错  
2楼2011-11-01 19:03:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 26申博自荐 +3 whh869393 2026-03-24 3/150 2026-03-24 09:55 by 21018060
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +3 我爱学电池 2026-03-23 3/150 2026-03-23 17:16 by AZMK
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
[考研] 352求调剂 +3 大米饭! 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123!
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
信息提示
请填处理意见