24小时热门版块排行榜    

查看: 695  |  回复: 2

语逸

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于VASP共线与非共线计算任务提交的脚本问题

#!/bin/bash
#
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -l walltime=240:00:00
#PBS -N h0.5-1
#PBS -j oe
#PBS -V
# setup runfile
# setup workpath and go to work dir
export MPICHROOT=/opt/intel/impi/4.0.0.027/bin
export VASPROOT=/export/apps
export PATH=$PATH:$VASPROOT:$MPICHROOT:.
logfile=log
cd $PBS_O_WORKDIR
# Define number of processors
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
# output PBS info to result
rm -f ./result
echo ================= PBS info ==================== >>result
echo Working directory is $PBS_O_WORKDIR >>result
echo Running on host `hostname` >>result
echo Directory is `pwd` >>result
echo This jobs runs on the following processors: >>result
echo `cat $PBS_NODEFILE` >>result
echo This job has allocated $NPROCS nodes >>result
echo  ********************************************** * >>result
echo  Start Time is `date` >>result
echo  ************************************************>>result
$MPICHROOT/mpirun -r ssh -v -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS $VASPROOT/vasp_nocoliear  > $logfile
echo ================================================ >>result
echo  ************************************************>>result
echo End Time is `date` >>result
echo  ************************************************>>result


用非共线算时需要设置$VASPROOT/vasp_nocoliear  > $logfile
共线算时是$VASPROOT/vasp_mpi> $logfile
我算了共线的但是脚本都用了非共线的设置。。。这样可以吗?请大家帮帮忙
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongjing123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

语逸(金币+2): 2011-11-18 08:48:43
没影响吧,不会报错
自己做个测试,

算非共线用了共线的设置肯定出错  
2楼2011-11-01 19:03:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

语逸

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chongjing123 at 2011-11-01 19:03:22:
没影响吧,不会报错
自己做个测试,

算非共线用了共线的设置肯定出错  

倒是没有报错,因为之前算共线都用了算非共线的脚本。。。在想是不是可以,主要是不大懂vasp.pbs脚本后面shell脚本,所以不敢确定可不可行,要是不行,前面的工作都。。。下午我蛮改了之前的几个任务中的脚本用了共线的,两个居然算死了,其他结果还没出来,好纠结啊
3楼2011-11-01 22:22:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 语逸 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见