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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

[求助] 用MS能否模拟自组装过程

请高手指教:用MS是否可以模拟两个分子之间由远到近过程的动力学过程?怎么实现这个过程?请大家帮忙,谢谢!
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我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

自己顶一下,请大家帮帮忙
我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
2楼2011-10-31 08:21:45
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

可以。你开始学习模拟多久了?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2011-11-02 16:31:36
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

完全模拟自组装还是很有难度的,里面有溶剂等。这些用溶剂效应估计也抵消不了。这个过程可以用NEB模拟,也可以sorption吸附,但是两者与真实的自组装还是很不一样。NEB是模拟这个过程能量和结构的变化等信息,需要知道初始和最后的结构。 sorption,只需要你的分子和衬底,但是分子不会与衬底形成建,而且一般也得不出一层整齐的膜

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2011-11-02 21:16:09
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-02 16:31:36:
可以。你开始学习模拟多久了?

非常感谢您的回复,我刚刚接触,还不是很熟悉,只是想做一个这样的模拟,才想学习一下,不知道模拟这个过程麻烦吗?需要学习多久呢?
我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
5楼2011-11-03 08:19:30
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-11-02 21:16:09:
完全模拟自组装还是很有难度的,里面有溶剂等。这些用溶剂效应估计也抵消不了。这个过程可以用NEB模拟,也可以sorption吸附,但是两者与真实的自组装还是很不一样。NEB是模拟这个过程能量和结构的变化等信息,需要 ...

非常感谢您,我才刚刚接触模拟,你说的这些对我来说都好陌生,我再好好看一下吧,谢谢
我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
6楼2011-11-03 08:25:52
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lushunqi

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

7楼2011-11-03 09:29:04
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

模拟自组装也是有的。北化工的王文川做过自组装,开起来使用分子动力学或者蒙特卡洛的方法。

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8楼2011-11-03 09:31:58
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-03 09:31:58:
模拟自组装也是有的。北化工的王文川做过自组装,开起来使用分子动力学或者蒙特卡洛的方法。

非常感谢您,我再查查相关文献。
我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
9楼2011-11-03 09:34:15
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lushunqi at 2011-11-03 09:29:04:
我也想做这方面的模拟,不知道楼主现在有什么想法吗

我现在也是刚想做这个模拟,具体还没有什么想法呢
我以微薄的力量,寻找属于自己的天堂!
10楼2011-11-03 09:34:55
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